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瓦莱丽·豪尔；克里斯汀·海奇（Christine E.Heitsch）。

RNA分支构型的参数分析。 （英语） Zbl 1214.92020年

牛市。数学。生物。 73，第4期，754-776（2011）.
摘要：受最近参数序列比对研究的启发，我们研究了用于评估RNA折叠的参数空间，并构建了RNA多聚体。这个多面体的顶点对应于具有共同分支的RNA二级结构。我们使用这个多面体和它的正常扇形体来研究自由能模型中三个参数变化的影响，这些参数不是实验确定的。我们的结果表明，这些特定参数的变化对自由能模型预测的结构没有显著影响。我们还将已知RNA二级结构的集合映射到RNA多胞体。

引用于三文件

MSC公司：

92C40型 生物化学、分子生物学
52个B05 多面体和多面体的组合特性（面数、最短路径等）

关键词：

RNA二级结构；平面树；自由能；热力学模型；参数分析

软件：

百万倍
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{V.Hower}和\textit{C.E.Heitsch}，公牛。数学。生物学73，第4期，754--776（2011；Zbl 1214.92020）
全文： 内政部 arXiv公司

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