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伯纳乌，米格尔·O。；拉斐尔·博尔达斯；普拉斯，巴赫马纳坦；乔·皮特·弗朗西斯；乔纳森·库珀；阿兰·加里；大卫·J·加瓦根。；布兰卡·罗德里格斯；James A.Southern。；乔纳森·怀特利（Jonathan P.Whiteley）。

Chaster：将一种新的多尺度时空算法集成到大型开源库中。 （英语） Zbl 1185.92057号

菲洛斯。事务处理。英国皇家学会。，序列号。A、 数学。物理。工程科学。 367，第1895号，1907-1930（2009）.
摘要：最近的工作描述了作为癌症、心脏和软组织环境（Chaster）项目的一部分而建立的软件工程和计算基础设施。Chaster是一个开源软件包，目前具有心脏和癌症建模功能。该软件是使用从商业部门引进的编程范式编写的，其代码经过了比该领域通常更严格的测试程序。在本文中，我们解释了如何将新功能并入Chaster。怀特利开发了一种数值算法，用于求解双域方程，该算法利用所建模生理学的多尺度（MS）特性来提高计算效率。据报道，该算法使用二维简单几何图形和特制代码，计算效率提高了两个数量级以上。在本文中，我们首先回顾了目前用于求解双域方程的数值方法，解释了如何开发这些方法来使用上述MS算法。然后，我们演示了在Chaster框架内使用此算法求解三维真实心脏几何体中的单域和双域方程。最后，我们讨论了如何开发Chaster以包含新的生理功能，例如模拟心脏跳动和心脏内的液体流动，以及如何合并旨在提高代码效率的新算法。

引用于三文件

MSC公司：

92 C50 医疗应用（一般）
92C30型 生理学（一般）
92-04 生物相关问题的软件、源代码等
92-08 生物问题的计算方法

关键词：

心脏建模；科学计算；软件工程；数值技术

软件：

贞洁；CellML手机
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{M.O.Bernabeu}等人，Philos。事务处理。英国皇家学会。，序列号。A、 数学。物理。工程科学。367，编号1895，1907--1930（2009；Zbl 1185.92057）
全文： 内政部

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