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E、 渭南;刘迪;埃里克·范登·伊恩登

多时间尺度化学动力学系统的嵌套随机模拟算法。 （英语） Zbl 1162.80003号

J.计算。物理学。 221，第1期，158-180（2007）.
摘要：我们提出了一种有效的数值算法来模拟多时间尺度的化学动力学系统。该算法是对传统随机模拟算法（SSA）的改进，也称为Gillespie算法。它以嵌套SSA的形式，使用外部SSA来模拟慢反应，其速率由模拟快速反应的内部SSA的实现计算得出。该算法本身是非常通用和无缝的，它相当于对原始SSA的一个小修改。我们对这种多尺度化学动力学系统的分析使我们能够识别系统中的慢变量，推导慢时间尺度上的有效动力学，并为嵌套SSA提供误差估计。利用这些误差估计讨论了嵌套SSA的效率，并通过几个数值例子进行了说明。

引用于36文件

MSC公司：

80A30型 热力学和传热中的化学动力学
80平方米 其他数值方法（热力学）（MSC2010）
65二氧化碳 蒙特卡罗方法
92E20型 化学中的经典流动、反应等

关键词：

动力学蒙特卡洛;连续时间马尔可夫链;化学主方程;随机Petri网;Gillespie算法;平均定理;多尺度数值方法;均匀化;随机建模;多尺度计算;化学动力学系统

软件：

罗德斯
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{W.E}等人，《计算杂志》。物理学。221，第158-180号（2007年；兹bl 1162.80003）
全文： 内政部

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