阿丽亚娜·马查多·利马；埃尔南多·德尔·波蒂略。；阿兰·米切尔·达勒姆 非编码RNA研究中的计算方法。 （英语） Zbl 1143.92010年 数学杂志。生物。 56，编号1-2，15-49（2008）. 摘要：非蛋白编码RNA（ncRNAs）是生物信息学的研究热点。最近的发现揭示了新的ncRNA家族发挥着多种作用，从基因表达调控到催化活性。据信，其他家庭仍有待揭晓。为蛋白质编码基因开发的计算方法在搜索ncRNA时经常失败。非编码RNA的功能通常严重依赖于其二级结构，这使得基因发现与蛋白质编码RNA基因非常不同。这推动了非编码RNA研究特定方法的发展。本文综述了用于识别非编码RNA和预测二级结构的主要方法。 引用于1文件 MSC公司： 92C40型 生物化学、分子生物学 92-08 生物学问题的计算方法 关键词：回顾；二级结构预测；结构比较；基因发现 软件：RNA形状；tRNA扫描-SE；法国皇家医学会；RNA动力学；CONTRAfold公司；ddbRNA；百万倍；snoSeeker（搜索引擎）；阿拉贡语；项目II；MARNA公司；Pfold（折叠）；PSoL公司；RSEACH公司；T-咖啡；Sfold公司；科福尔加 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{A.Machado-Lima}等人，《数学杂志》。生物学56，编号1--2，15--49（2008；Zbl 1143.92010） 全文： 内政部 参考文献： [1] Abrahams J.P.、van den Berg M、van Batenburg E.、Pleij C.（1990）。通过计算机模拟预测RNA二级结构，包括假结。核酸研究18（10）：3035–3044·doi:10.1093/nar/18.10.3035 [2] Akmaev V.R.、Kelley S.T.、Stormo G.D.（2000年）。用于RNA结构预测的进化增强统计工具。生物信息学16（6）:501–512·doi:10.1093/bioinformatics/16.6.501 [3] Allali J.，Sagot M.F.（2005年）。高水平RNA二级结构比较的新距离。事务处理。计算。生物信息。2(1): 3–14 ·Zbl 05103333号 ·doi:10.1109/TCBB.2005.2 [4] 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