鲍勃·茅;迈克尔·牛顿（Michael A.Newton）。;布雷特·拉格 基于马尔可夫链蒙特卡罗方法的贝叶斯系统发育推断。 （英文） Zbl 1059.62675号 生物计量学 55，第1期，第1-12页（1999年）. 小结：我们从一棵系统发育树的后验分布中导出了一个马尔可夫链来采样，给定了来自相应生物集合的序列信息、这些数据的随机模型以及树空间上的先验分布。将树转换为标准同调矩阵形式，可以提供一种简单有效的建议分布，用于选择链中靠近当前树的候选树。我们用9种植物的限制性位点数据说明了该算法，然后扩展到32种鱼类的DNA序列。该算法在随机起始树的两个例子中都很好地混合在一起，为进化路径生成可重复的估计和可信的集合。 引用于8文件 MSC公司： 62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用；元分析 2015年1月62日 贝叶斯推断 92D15型 与进化有关的问题 65立方厘米 马尔可夫链的数值分析或方法 关键词：同调矩阵;进化;Metropolis-Hastings算法;系统发育重建 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{B.Mau}等人，《生物统计学》55，第1期，第1-12页（1999；Zbl 1059.62675） 全文： 内政部 参考文献： [1] Besag J.，《英国皇家统计学会期刊》，B系列55，第25页– [2] Camin J.H.，《进化》第19页，第311页—— [3] Cowles M.K.，《美国统计学会杂志》91 pp 883–·doi:10.1080/01621459.1996.10476956 [4] Evans S.，《统计年鉴》21，第355页– [5] Felsenstein J.，《系统动物学》，第27页，第27– [6] Felsenstein J.，《分子进化杂志》17，第368页–·Zbl 0528.62090号 [7] Felsenstein J.，《皇家统计学会杂志》，A辑146页246– [8] Felsenstein J.，《进化》39，第783页–（1985） [9] 内政部：10.1086/284325·doi:10.1086/284325 [10] Felsenstein J.，《遗传学年度评论》，第22页，第1页·Zbl 0528.62090号 [11] Felsenstein J.，《进化》第46页，第159页—— [12] Fitch W.M.，《科学》155页，第279页– [13] Geyer C.J.，《统计科学》第7页，第437页—— [14] Goldman N.，《系统动物学》39，第345页- [15] Goldman N.，《分子进化杂志》，第36页，第182页– [16] 内政部：10.1006/tpbi.1994.1023·Zbl 0807.92015年 ·doi:10.1006/tpbi.1994.1023 [17] Griffiths R.C.，《统计科学》第9卷第307页–（1994年） [18] 长谷川M.，Evolution 43 pp 672– [19] 长谷川M.，《分子进化杂志》22，pp 160– [20] Huelsenbeck J.P.，《科学》276第227页- [21] Kocher T.D.，《分子系统发育和进化》，第4页，420– [22] Kuhner M.K.，《人口遗传学和人类进化进展》87页183–·doi:10.1007/978-1-4757-2609-1_11 [23] Lapointe F.-J.，《分类杂志》第8卷第177页·兹比尔0825.62542 [24] Lapointe F.-J.，《系统生物学》41第158页 [25] S.Li、D.K.Pearl和H.Doss（）。利用马尔可夫链蒙特卡罗构建系统发育树。哥伦布俄亥俄州立大学统计系技术报告583。 [26] Mau B.，《计算与图形统计杂志》，第6页，第122页 [27] Navidi W.C.，《生物统计学》第49页，第543页– [28] Newton M.A.，《生物统计学》83第315页- [29] M.A.Newton、B.Mau、B.Larget、F.Seillier-Moiseiwitsch、P.Donnelly和M.Waterman（）。马尔可夫链蒙特卡罗用于对对齐分子序列的进化树进行贝叶斯分析。在华盛顿州西雅图举行的AMS-IMS-SIAM统计和分子生物学联合夏季研究会议记录中，正在印刷中。 [30] Rambaut A.，CABIOS 13第235页- [31] Schoniger M.，分子系统发育与进化3 pp 240– [32] Sinsheimer J.S.，《生物统计学》，第52页，第193页—— [33] Smouse体育，《进化》第43页，第1162页—— [34] Sokal R.R.，《数值分类学》·doi:10.1038/科学美国人1266-106 [35] Swofford D.L.，《分子系统学》第407页–，第2页。预计起飞时间。 [36] Sytsma K.J.，《进化》第40页，第1248页—— [37] S.Tavare和Y.Feng（）。当站点依赖时重建系统发育树。新泽西州皮斯卡塔韦罗格斯大学DIMACS技术报告95-48，55-57。 [38] Tierney L.，《统计年鉴》22第1701页– [39] Yang Z.，树木11，第367页– [40] Yang Z.，《分子生物学与进化》14，第717页-·doi:10.1093/oxfordjournals.molbev.a025811 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配，可能包含数据转换错误。在某些情况下，zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献，而不要求完整或完全匹配。