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J·阿加瓦尔。；亨尼·D·。

包含纵向自由度的非线性DNA模型的呼吸解。 （英语） Zbl 1036.92014号

物理A 323，编号1-4，519-533（2003）.
摘要：我们提出了一个DNA双螺旋模型，为每对核苷酸分配三个自由度。该模型是Barbi-Cocco-Peyrard（BCP）模型的扩展，即当前模型允许核苷酸平行于螺旋轴的纵向运动。双螺旋的分子结构由耦合振荡器系统模拟。核苷酸由点质量表示，并通过点-点相互作用势耦合。后者描述了负责DNA二级结构的共价键和氢键。
我们从反耦合极限出发，利用一种在非线性晶格上构造呼吸子的既定方法，获得了呼吸子解。为了应用这种方法，我们分析了与我们的模型相对应的线性化系统的声子谱。获得的呼吸运动包括碱基对的局部开放和重新闭合，以及螺旋线的局部解捻。纵向运动的振幅远低于径向和角向伸长。

引用于4文件

MSC公司：

92C40型 生物化学、分子生物学
92C05型 生物物理学
第82天60 聚合物统计力学

关键词：

核苷酸纵向运动；耦合振荡器系统；点-点相互作用势
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{J.Agarwal}和\textit{D.Hennig}，《物理学A 323》，第1--4519-533期（2003；Zbl 1036.92014）
全文： 内政部

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