马克·塔克曼(Mark E.Tuckerman)。;纱线,D.A。;沙恩·奥·萨缪尔森。;亚当·休斯。;格伦·马蒂纳。 通过分布式内存计算机上的现代技术和软件范例,在基于分子动力学的计算中利用多个级别的并行性。 (英语) 兹比尔1002.81056 计算。物理。Commun公司。 128,编号1-2,333-376(2000)。 摘要:现代分子动力学方法用于研究量子多体系统、包括显式电子自由度在内的化学反应系统及其组合,以及大型经典生物分子系统。因此,现在可以常规检查诸如同位素对酶反应的影响等复杂问题。本文综述了现代分子动力学方法及其在量子多体系统和电子结构计算中的应用。然而,由此产生的方法虽然强大,但计算量很大。因此,利用这些技术的数学结构开发了采用多级离散化的分布式存储并行算法。这些多层次并行方法是有效的,并允许大型复杂系统,如酶催化,易于处理。此外,还展示了如何使用现代面向对象编程范式在大型计算包中快速高效地实现多级并行算法。最后,使用\(\text获得的结果和时间{松果}_-本文给出了作者为各种新型系统开发的包。 引用于5文件 MSC公司: 81V70型 多体理论;量子霍尔效应 81V55型 分子物理学 81-02 与量子理论有关的研究博览会(专著、调查文章) 81-08 量子理论相关问题的计算方法 92E10型 分子结构(图形理论方法、微分拓扑方法等) 关键词:量子多体系统;化学反应体系;生物分子系统;同位素对酶反应的影响;多层并行方法 软件:OOMPAA公司 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{M.E.Tuckerman}等人,《计算》。物理。Commun公司。128,编号1--2,333--376(2000;Zbl 1002.81056) 全文: 内政部