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使用受影响谱系成员进行的一类连锁测试。 (英语) Zbl 0824.62100号

摘要:我们描述了一类非参数检验,用于检测标记物和假设存在的基因之间的联系,并控制对疾病的易感性。这些测试是通过对受影响的谱系成员之间标记等位基因共享(血统认同)的每种可能模式进行评分,然后对与观察到的标记基因型和受影响成员的谱系关系兼容的所有模式的评分进行平均而形成的。不同的分数函数给出不同的测试。其中一个功能是检查一对受影响谱系成员之间的标记等位基因相似性,它给出了一个类似于R.菲默斯等【in:基于受影响谱系成员的多点定位和连锁:遗传分析研讨会,123-128(1989)】。第二个功能检查受影响成员的任意子集(而不仅仅是成对)之间的等位基因相似性。结果测试可能比仅基于受影响成员对的测试更强大。
这种方法有几个优点:它不需要了解疾病的遗传模式;它不需要在标记处通过血统明确确定身份;它不会因受影响的无关成员(如配偶)之间的等位基因相似性而发生变异;它允许未受影响成员的标记基因型提供受影响成员之间等位基因共享的信息;它允许计算精确的P值。计算要求将测试限制在许多预测范围内,受影响的构件很少(<16)。

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62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用;元分析
62G10型 非参数假设检验
92D10型 遗传学和表观遗传学
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