是的,Kim-Anh;彼得·米勒;唐凤 差异基因表达的贝叶斯混合模型。 (英文) Zbl 1490.62353号 J.R.Stat.Soc.,塞尔维亚。C、 申请。斯达。 54,第3期,627-644(2005). 摘要:我们提出了基于模型的差异基因表达推断,使用非参数贝叶斯概率模型来计算不同条件下的基因强度分布。概率模型是正态分布的混合。结果推理类似于用于相同推理问题的流行经验贝叶斯方法。使用完全基于模型的推理减轻了经验贝叶斯方法的一些必要限制。我们认为,在传统的非参数正态混合模型中,推理并不比后验模拟困难。提出的方法是由一项微阵列实验激发的,该实验旨在识别正常组织和结肠癌组织样本之间差异表达的基因。此外,我们还进行了一个小型仿真研究,以验证所提出的方法。在激励性的案例研究中,我们展示了非参数贝叶斯方法如何促进对后验期望错误发现率的评估。我们还展示了即使没有已知非差异表达分数的空样本,推理也可以如何进行。这突出了与基于插件估计的其他经验贝叶斯方法的区别。 引用于45文件 MSC公司: 62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用;元分析 2015年1月62日 贝叶斯推断 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{K.-A.Do}等人,J.R.Stat.Soc.,Ser。C、 申请。Stat.54,No.3,627--644(2005;Zbl 1490.62353) 全文: 内政部 参考文献: [1] 数字对象标识码:10.1073/pnas.96.12.6745·doi:10.1073/pnas.96.12.6745 [2] Antoniak C.E.,Ann.统计师。第2页,1152页–(1974年) [3] 内政部:10.1089/106652701753307539·doi:10.1089/106652701753307539 [4] Benjamini Y.,J.R.统计。Soc 57第289页–(2002年) [5] 内政部:10.1093/biomet/83.181·Zbl 0866.62024号 ·doi:10.1093/biomet/83.1.81 [6] 陈明,技术报告(2004) [7] 内政部:10.1117/1.429838·doi:10.117/1.429838 [8] De Iorio M.,J.Am.统计。评估99第205页–(2004) [9] 内政部:10.1198/016214501753382129·Zbl 1073.62511号 ·doi:10.1198/016214501753382129 [10] M.Escobar(1988)通过估计平均值的分布来估计几个正常人群的平均值。博士论文。纽黑文耶鲁大学。 [11] 埃斯科瓦尔医学博士、美国统计学家J.Am。资产负债表90第577页–(1995年) [12] 弗格森·T·S·安·统计师。第1页209–(1973) [13] 内政部:10.1198/106186002760180518·doi:10.1198/106186002760180518 [14] 内政部:10.1111/1467-9868.00347·Zbl 1090.62072号 ·doi:10.1111/1467-9868.00347 [15] Genovese C.,贝叶斯统计7(2003) [16] MacEachern S.,公共统计师。Simuln Computen 23第727页–(1994年) [17] MacEachern S.N.,稳健贝叶斯分析第295页–(2000)·Zbl 1281.62070号 ·doi:10.1007/978-1-4612-1306-2_16 [18] DOI:10.1093/bioinformatics/18.3.413·doi:10.1093/bioinformatics/18.3.413 [19] 内政部:10.1038/35077582·doi:10.1038/35077582 [20] Muller P.,J.Am.统计师。助理(2004) [21] Muller P.,应用。统计师。0 (2005) [22] 内政部:10.1089/106652701300099074·doi:10.1089/106652701300099074 [23] DOI:10.1093/生物统计/5.2.155·Zbl 1096.62124号 ·doi:10.1093/biostatistics/5.2.155 [24] 潘伟,《基因组生物学》。3 pp研究009.1–(2002) [25] DOI:10.111/1467-9868.00358·Zbl 1067.62117号 ·doi:10.1111/1467-9868.00358 [26] DOI:10.1093/生物信息学/btg148·doi:10.1093/生物信息学/btg148 [27] 内政部:10.1093/bioinformatics/btf877·doi:10.1093/bioinformatics/btf877 [28] DOI:10.1089/106652701753307485·doi:10.1089/106652701753307485 [29] Scott J.,技术报告(2003) [30] Sethurman J.,统计师。罪恶。第4页,639页–(1994年) [31] Smyth G.K.,《功能基因组学:方法和协议》(2002年) [32] 内政部:10.1111/1467-9868.00346·Zbl 1090.62073号 ·doi:10.1111/1467-9868.00346 [33] Storey J.S.,《基因表达数据分析:方法和软件》(2003年) [34] Tierney L.,Ann.统计师。第22页,第1701页–(1994年) [35] V.G.Tusher、R.Tibshirani和G.Chu(2002)应用于电离辐射反应的微阵列显著性分析,98 , 5116 -5121 . ·2014年12月10日 [36] 内政部:10.1111/1467-9868.00190·Zbl 0983.62027号 ·数字对象标识代码:10.1111/1467-9868.00190 [37] DOI:10.1002/1096-9896(200109)195:1<53::AID-PATH891>3.0.CO;2-H型·doi:10.1002/1096-9896(200109)195:1<53::AID-PATH891>3.0.CO;2-H型 [38] 内政部:10.1117/12.427982·doi:10.1117/12.427982 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配,可能包含数据转换错误。在某些情况下,zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献,而不要求完整或完全匹配。