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差异基因表达的贝叶斯混合模型。 (英文) Zbl 1490.62353号

摘要:我们提出了基于模型的差异基因表达推断,使用非参数贝叶斯概率模型来计算不同条件下的基因强度分布。概率模型是正态分布的混合。结果推理类似于用于相同推理问题的流行经验贝叶斯方法。使用完全基于模型的推理减轻了经验贝叶斯方法的一些必要限制。我们认为,在传统的非参数正态混合模型中,推理并不比后验模拟困难。提出的方法是由一项微阵列实验激发的,该实验旨在识别正常组织和结肠癌组织样本之间差异表达的基因。此外,我们还进行了一个小型仿真研究,以验证所提出的方法。在激励性的案例研究中,我们展示了非参数贝叶斯方法如何促进对后验期望错误发现率的评估。我们还展示了即使没有已知非差异表达分数的空样本,推理也可以如何进行。这突出了与基于插件估计的其他经验贝叶斯方法的区别。

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62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用;元分析
2015年1月62日 贝叶斯推断
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全文: 内政部

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