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DNA序列进化的混合模型分析。 (英语) Zbl 0832.62095号

摘要:DNA序列中的核苷酸可能以不同的速度变化,因为它们位于基因的不同结构和功能区域,因此受到不同的突变压力或选择性限制。了解特定位点的取代率对于理解形成DNA序列进化的力量和机制非常重要。伽马分布曾被提议用于模拟核苷酸位点之间的这种速率变化。
基于混合模型方法,我们提出了一种利用同源DNA序列预测核苷酸位点替代率的方法。从最小均方误差和最大预测值与真实值之间的相关性的意义上来说,预测值是无偏和“最佳”的。它对模型中参数估计的误差也相当稳健。给出了一个数值例子,为该方法的实际应用提供了指导。影响预测准确性的最有影响的因素是序列的数量;为了在预测值和真值之间获得大于7的相关性,根据序列的总体相似性,大约需要6到7个序列。

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62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用;元分析
92D20型 蛋白质序列,DNA序列
92D15型 与进化有关的问题
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全文: 内政部