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合并模型简化。 (英语) Zbl 1342.68077号

Mislove,Michael(ed.)等人,《第26届编程语义数学基础会议论文集》(MFPS 2010),加拿大渥太华,2010年5月6日至10日。阿姆斯特丹:爱思唯尔。理论计算机科学电子笔记26573-96(2010)。
摘要:分子生物学模型通常会发生大规模的组合爆炸。事实上,蛋白质形成复合物并相互修饰,这导致形成大量不同的化学物种(即蛋白质的非同构连接成分)。因此,我们无法明确生成这些模型的定量语义,更不用说计算它们的属性了。模型简化旨在通过提供另一种观测来降低这种复杂性。在本文中,我们提出了两个用于组合模型约简的统一框架:我们提出了一个用于组合随机语义的模型约简的对称乘积算子,并说明了如何通过线性投影进一步抽象现有的约简微分系统。我们应用这两个框架,通过考虑蛋白质中结合位点之间的对称性,进一步抽象出用Kappa编写的模型的现有简化定量语义。
关于整个系列,请参见[Zbl 1281.68037号].

MSC公司:

68号30 软件工程的数学方面(规范、验证、度量、需求等)
68问题55 计算理论中的语义学
92C40型 生物化学、分子生物学
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全文: 内政部

参考文献:

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