马修·麦考利;布兰迪林·斯蒂格勒 通过单项式理想的初级分解推断分子网络中的相互作用。 （英语） Zbl 1409.92096号 Robeva，Raina（编辑）等，代数和组合计算生物学。阿姆斯特丹：爱思唯尔/学术出版社。数学。科学。工程，175-211（2019）。 摘要：逻辑或布尔网络等离散模型是建模生物系统的常用选择，特别是在分子生物学中。例如基因调控网络、蛋白质相互作用网络、信号网络等。第4章介绍了这些类型模型的一般框架，称为局部模型，这包括逻辑网络和布尔网络作为特例。我们鼓励读者先阅读第四章。在本章中，我们将研究建模中出现的一个特殊数学问题，我们可以使用计算代数来解决这个问题。具体来说，假设我们希望从“部分数据”中了解生物系统。也就是说，我们知道一些输入和输出值，目的只是确定哪些更新函数依赖于哪些变量。此外，有时我们希望确定哪些节点是激活器，哪些节点是抑制剂。这些数据可能来自基因沉默或基因敲除实验。我们解决这个问题的方法包括构造一个无平方单项式或伪多项式理想，对数据进行编码，然后从主分解中提取相关性。关于整个系列，请参见[Zbl 1404.92006年]. 引用于1文件 MSC公司： 92立方厘米 系统生物学、网络 94立方厘米 交换理论，布尔代数的应用；布尔函数（MSC2010） 关键词：生物系统;生物分子网络;布尔网络 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{M.Macauley}和\textit{B.Stigler}，in：代数和组合计算生物学。阿姆斯特丹：爱思唯尔/学术出版社。175-211（2019年；Zbl 1409.92096） 全文： 内政部