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使用具有上下文敏感核函数的支持向量机进行拼接位点预测。 (英语) Zbl 1217.68182号

摘要:本文重点研究了支持向量机在一个典型的上下文相关分类任务剪接位点预测中的应用。对于这类问题,已经表明,基于上下文的方法应优先于转换方法,因为前者可以很容易地合并统计度量或直接将敏感性信息插入距离函数。本文设计了三类上下文敏感核函数:基于多项式的核函数、基于径向基函数的核函数和基于负距离的核函数。从实验结果可以清楚地看出,具有信息增益加权的基于径向基函数的核获得了最好的精度,并且在精度和模型复杂度方面总是优于简单的非敏感核。通过精心设计的功能和精心选择的上下文大小,我们的系统可以以相当高的精度预测剪接位点,可以达到FP 95%的比率,供体位点达到3.94,受体位点达到5.98,这是目前最先进的性能。

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68T05型 人工智能中的学习和自适应系统
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