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尼基尔·班萨尔;莫舍·勒文斯坦;马斌;张凯忠

关于最长公共刚性子序列问题。 （英语） Zbl 1191.68216号

算法 56，第2期，270-280（2010）.
摘要：最长公共子序列问题（LCS）和最近子串问题（CSP）是寻找字符串中公共模式的两种模型，已经得到了广泛的研究。尽管LCS和CSP都是NP难算法，但相对于多项式时间近似算法，它们表现出非常不同的行为。虽然对于某些\（\delta>0\），LCS很难在\（n^｛\delta｝\）内近似，但CSP允许多项式时间近似方案。本文研究最长公共刚性子序列问题。这个问题与LCS和CSP都有相似之处，并且在生物序列的模体发现中有重要应用。我们证明，对于某些常数（delta>0），在比率\（n^{delta}\）内，它是近似LCRS的NP-hard，其中\（n\）是最大字符串长度。我们还表明，在比率\（\Omega（m）\）内，它是NP-Hard到近似LCRS，其中\（m\）是字符串数。

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关键词：

最长公共子序列;最长公共刚性子序列;近似算法;主题发现;模式匹配与计算生物学

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\textit{N.Bansal}等人，Algorithmica 56，No.2，270--280（2010；Zbl 1191.68216）
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