托马斯·拉迪沃耶维奇;大卫·霍尔(David G.Hoel)。;菲利普·哈恩费尔特;Sachs,Rainer K。 辐照细胞中错接DNA片段的大小分布。 (英语) Zbl 0942.92018号 数学。Biosci公司。 149,第2期,第107-136页(1998年)。 摘要:电离辐射照射细胞时,会导致DNA双链断裂(DSB)。随后,一些DSB重新组合错误,从而导致DNA片段大小分布的改变。我们导出了一个非线性积分-微分方程组,描述了五类DNA片段(包括环和各种类型的线性片段)的错误重新连接相互作用。碎片类别由密度函数表示;密度函数的形状决定了碎片具有特定大小的概率,并且振幅(积分)等于每个细胞中碎片的预期数量。求解方程:对指数分布的初始碎片尺寸(对应于高剂量)进行解析,对任意初始条件进行数值求解。计算的最终片段大小分布适用于代表流动核型和脉冲场凝胶分析的情况。对于人流核型,该模型可用于在传统数据分析方法无法获得的过高剂量下获得错误重接估计值。对于使用限制性内切酶消化人类染色体以形成“切割体”(限制性片段)的脉冲场凝胶分析,当切割体大小非随机时,该模型提供了一种错误重新加入估计的方法。该模型表明,如果未受辐射细胞的切割体尺寸分布是完全随机的,则在最终尺寸分布中不会检测到辐射诱导DSB的误拼接。 引用于1文件 MSC公司: 92 C50 医疗应用(通用) 92C05型 生物物理学 45K05型 积分-部分微分方程 关键词:SSEB模型;DNA片段大小;双绞线断裂;重新加入不当 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{T.Radivoyevitch}等人,数学。Biosci公司。149,编号2,107--136(1998;Zbl 0942.92018) 全文: DOI程序 参考文献: [1] M.N.Cornforth,辐射诱导损伤和染色体畸变的形成,摘自:J.A.Nickoloff,M.F.Hoekstra(编辑),DNA损伤和修复-生物化学、遗传学和细胞生物学,新泽西州人类出版社,1997年;M.N.Cornforth,辐射诱导损伤和染色体畸变的形成,摘自:J.A.Nickoloff,M.F.Hoekstra(编辑),DNA损伤和修复-生物化学、遗传学和细胞生物学,新泽西州人类出版社,1997年 [2] Löbrich,M。;里德伯格,B。;Cooper,P.K.,修复X射线诱导的特定DNA双链断裂不是我人类成纤维细胞中的限制性片段:正确和错误末端的连接,Proc。国家。阿卡德。科学。,921250(1995年) [3] Contopoulou,C.R。;库克,V.E。;Mortimer,R.K.,用正交场交替凝胶电泳分析DNA双链断裂和修复,《酵母》,3,71(1987) [4] Blöcher,D.,在CHEF电泳中,DSB的线性诱导对应于提取DNA的非线性部分与剂量,Int.J.Radiate。生物学,57,7(1990) [5] 库克,V.E。;Mortimer,R.K.,电离辐射产生的DNA片段的定量模型,以及可能的实验应用,Radiate。决议,125,102(1991) [6] Radivoyevitch,T。;Cedervall,B.,脉冲场凝胶电泳DNA片段分布模型的数学分析,电泳,171087(1996) [7] T.Radivoyevitch,错接DNA双链断裂和DNA片段大小分布的数学模型,博士论文,南卡罗来纳医科大学生物计量学和流行病学系,查尔斯顿,SC 294251996年12月;T.Radivoyevitch,错接DNA双链断裂和DNA片段大小分布的数学模型,博士论文,南卡罗来纳医科大学生物计量学和流行病学系,查尔斯顿,SC 294251996年12月 [8] 塞德瓦尔,B。;Källman,P。;杜威,W.C.,《DNA双链断裂的修复:在脉冲场凝胶电泳和中性过滤洗脱中测定半衰期时遇到的错误》,Radia。研究,142,23(1995) [9] Kraxenberger,A。;弗里德尔·A·A。;Keller,A.M.,脉冲场凝胶运行的计算机模拟允许定量酵母中辐射诱导的双链断裂,电泳,15,128(1994) [10] Dietzel,A.H。;Hain,J。;Virsik-Peuckert,R.P。;Harder,D.,从流式核型中评估辐射诱导的每个细胞的染色体畸变率的算法,细胞学,11708(1990) [11] Sax,K.,X射线诱发染色体畸变的分析紫露草属《遗传学》,25,41(1940) [12] Radivoyevitch,T。;霍尔,D.G。;陈,A.M。;Sachs,R.K.,X射线照射后双链断裂的错接:通过马尔可夫模型关联中到极高剂量,Radiate。Res.,149,59(1998) [13] Löbrich,M。;库珀,P.K。;Rydberg,B.,《粒子辐照引起的DNA双链断裂的非随机分布》,国际放射杂志。《生物学》,70493(1996) [14] 纽曼,H.C。;Prise,K.M。;Folkard,M。;Michael,B.D.,X射线和α粒子照射的V79细胞中的DNA双链断裂分布:非随机断裂的证据,Int.J.Radiat。《生物学》,71,347(1997) [15] A.V.Oppenheim、A.S.Wilsky、I.T.Young,《信号与系统》,新泽西州恩格尔伍德悬崖Prentice-Hall,1983年;A.V.Oppenheim、A.S.Wilsky、I.T.Young,新泽西州恩格尔伍德悬崖Prentice-Hall的信号和系统,1983年·Zbl 0539.93001号 [16] Hlatky,L.公司。;Sachs,R.K。;Hahnfeldt,P.,辐射人体淋巴细胞中心环与双中心的比率,Radiate。决议,129304(1992) [17] 陈,A.M。;Lucas,J.N。;希尔,F.S。;布伦纳,D.J。;Sachs,R.K.,FISH测量的染色体畸变的邻近效应,国际放射杂志。《生物学》,69,411(1996) [18] Löbrich,M。;Ikpeme,S。;Kiefer,J.,《用脉冲场凝胶电泳测量哺乳动物细胞中的DNA双链断裂:一种使用很少切割限制性内切酶的新方法》,Radiate。决议,138186(1994) [19] 弗里德尔·A·A。;Kraxenberger,A。;Eckardt-Schupp,F.,评估哺乳动物细胞DNA双链断裂空间分布的电泳方法,电泳,16,1865(1995) [20] 莱文,S.D。;Zimm,B.H.,使用脉冲场电泳分离开环DNA,Proc。国家。阿卡德。科学。,84, 4054 (1987) 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配,可能包含数据转换错误。在某些情况下,zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献,而不要求完整或完全匹配。