马克·扎贾克;杰拉尔德·琼斯。;詹姆斯·格雷泽(James A.Glazier)。 通过各向异性微分粘附模拟收敛扩展。 (英语) 兹比尔1464.92093 J.西奥。生物。 222,第2期,247-259(2003). 摘要:使用扩展Potts模型进行的模拟表明,各向异性差异粘附可以解释青蛙胚胎发育期间观察到的收敛延伸非洲爪蟾例如。在这些蛙类的原肠胚形成期间,会聚延伸通过纬向延伸和排列的组成细胞的迁移产生纵向组织生长。扩展的Potts模型使用网格上的聚集点来表示细分细胞,细胞边界的概率位移使得能量的微小变化驱动组织的逐渐发育。对于收敛扩展的建模,模拟包括各向异性差异粘附:相邻细长细胞之间的粘附程度取决于它们的相对方向。在不考虑其他机制的情况下,基于各向异性差异粘附的模拟再现了正确序列中收敛扩展的特征阶段,随机波动是细胞重组的充分动力。 引用于三文件 MSC公司: 92立方37 细胞生物学 92立方厘米 发育生物学,模式形成 关键词:会聚伸展;差异粘附;计算机模拟;能量最小化 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{M.Zajac}等人,J.Theor。生物学222,第2期,247--259(2003;Zbl 1464.92093) 全文: 内政部 参考文献: [1] 阿加瓦尔,P.,1993年。发育生物学中基于细胞的计算机模型。纽约大学博士论文。;阿加瓦尔,P.,1993年。发育生物学中基于细胞的计算机模型。纽约大学博士论文。 [2] Agarwal,P.,《聚合模拟》粘液菌使用单元编程语言Compute。申请。Biosci,10,6,647-655(1994) [3] 阿加瓦尔,P.,《细胞编程语言》,Artif。生活,2,1,37-77(1995) [4] Agarwal,P.,《使用细胞编程语言的细胞分离和吞噬模拟》,J.theor。生物学,176,179-89(1995) [5] Arfken,G.,《物理学家的数学方法》(1985),学术出版社:学术出版社,佛罗里达州奥兰多·Zbl 0135.42304号 [6] Armstrong,P.B.,《体外组织自组装的细胞分选》,《生物化学评论》。分子生物学。,24, 2, 119-149 (1989) [7] 康迪奇,M。;弗里斯特罗姆,J。;Fristrom,D.,心尖细胞形状在果蝇属想象腿盘伸长一种新的形态发生机制,Development,111,23-33(1991) [8] Drasdo,D。;克雷,R。;McCaskill,J.S.,组织细胞群的蒙特卡罗方法,物理学。E版,52、6、6635-6657(1995) [9] Elul,T。;科尔,M.A.R。;Keller,R.,神经收敛扩展的细胞机制非洲爪蟾胚胎,发育生物学。,191, 243-258 (1997) [10] Fowlse,G.R.,1985年。分析力学,第4版。桑德斯金色阳光系列。桑德斯学院出版社,伦敦。;Fowlse,G.R.,1985年。分析力学,第4版。桑德斯金色阳光系列。桑德斯学院出版社,伦敦。 [11] Gilks,W.R.,Richardson,S.,Spieglhalter,D.J.(编辑),1996年。马尔可夫链蒙特卡罗实践。查普曼和霍尔,博卡拉顿,佛罗里达州,美国。;Gilks,W.R.,Richardson,S.,Spieglhalter,D.J.(编辑),1996年。马尔可夫链蒙特卡罗实践。查普曼和霍尔,博卡拉顿,佛罗里达州,美国·Zbl 0832.00018号 [12] Glazier,J.A。;Graner,F.,《生物细胞差异驱动粘附重排的模拟》,Phys。E版,47、3、2128-2154(1993) [13] 新南威尔士州戈尔。;Leith,A.G.,各向同性细胞的自我分类,J.theor。生物学,28469-482(1970) [14] 新南威尔士州戈尔。;Rodgers,G.,胚胎组织吞噬和其他运动的计算机模拟,J.theor。生物学,71,103-140(1978) [15] 新南威尔士州戈尔。;坎贝尔,R。;罗森,R。;Maritnez,H。;Ycas,M.,各向同性细胞的自分类,J.theor。生物学,28423-468(1970) [16] Goldstein,H.,1980年。经典力学,第2版。Addison-Wesley物理学系列。Addison-Wesley,Don Mills,安大略省。;戈尔茨坦,H.,1980年。经典力学,第2版。Addison-Wesley物理学系列。Addison-Wesley,Don Mills,安大略省·Zbl 0491.70001号 [17] Graner,F.,表面粘附能驱动细胞重排吗?第一部分生物学细胞分选,理论J。《生物学》,164,455-476(1993) [18] Graner,F。;Glazier,J.A.,使用二维扩展Potts模型模拟生物细胞分类,Phys。修订稿。,69, 13, 2013-2016 (1992) [19] 哈丁,J.D。;程丽英,海胆发育过程中原肠伸长的机制和机制,生物发展杂志。,115, 490-501 (1989) [20] Huttenlocher,A。;Sandborg,R.R。;Horowitz,A.F.,细胞迁移中的粘附,当前。操作。细胞生物学。,7, 697-706 (1995) [21] 欧文,K.D。;Wieschaus,E.,细胞插入果蝇属种带延伸及其由成对规则分割基因的调控,Development,120,4,827-841(1994) [22] 雅各布森。;Moury,J.D.,神经形成期间的组织边界和细胞行为,Dev.Biol。,171, 98-110 (1995) [23] 姜瑜,1998。细胞形态形成。印第安纳州圣母大学博士论文。;姜瑜,1998。细胞形态形成。印第安纳州圣母大学博士论文。 [24] 凯勒,R。;Hardin,J.,《活性细胞重排期间的细胞行为证据和推测》,J.Cell Sci。补遗,8369-393(1987) [25] 凯勒,R。;Shih,J.,青蛙胚胎轴向中胚层聚合和伸展期间的细胞和组织行为非洲爪蟾,(Beysens,D.;Forgacs,G.;Gaill,F.,《生物形态发展中遗传和物理过程的相互作用》,Les Houches Series(1995),《世界科学:世界科学》,纽约),143-153 [26] Keller,R.,Cooper,M.S.,Danilchik,M.,Tibbetts,P.,Wilson,Paul,A.,1989年。脊索发育过程中的细胞间插非洲爪蟾,动物实验杂志。251, 134-155.; Keller,R.,Cooper,M.S.,Danilchik,M.,Tibbetts,P.,Wilson,Paul,A.,1989年。脊索发育过程中的细胞间插非洲爪蟾J.Exp.动物园。第251页,第134-155页。 [27] 凯勒,R。;Shih,J。;Wilson,P.,原肠胚形成期间的细胞运动、控制和会聚与伸展功能爪蟾,(Keller,R.;Clark,W.;Griffin,F.,《消化:运动、模式和分子》,Bodega海洋实验室,海洋科学系列3(1991),Plenum出版社:Plenum Press New York),第101-119页 [28] 凯勒,R。;戴维森,L。;Edlund,A。;Elul,T。;埃辛,M。;肖克,D。;Skoglund,P.,《细胞插入的聚合和延伸机制》,Philos。事务处理。R.Soc.B,355、1399、897-922(2000) [29] Koonin,S.E。;Meredith,D.C.,《计算物理(FORTRAN版本)》(1990年),Addison-Wesley:Addison-Whesley New York·Zbl 0699.65001号 [30] 劳芬伯格,D。;Horwitz,A.F.,《细胞迁移——物理整合的分子过程》,《细胞》,84,359-369(1996) [31] 北卡罗来纳州大都会。;罗森布鲁斯,M。;罗森布鲁斯,A。;出纳员,A。;Teller,E.,快速计算机器的状态方程计算,J.Chem。物理。,21, 1087-1092 (1953) ·Zbl 1431.65006号 [32] 梅耶,P.,2000年。纯自旋模型和稀自旋模型的计算研究。德比大学数学与计算学院硕士论文。;梅耶,P.,2000年。纯自旋模型和稀自旋模型的计算研究。德比大学数学与计算学院硕士论文。 [33] 米奇逊,T.J。;Cramer,L.P.,基于肌动蛋白的细胞运动和细胞运动,《细胞》,84,371-379(1996) [34] Mombach,J.C.M。;德阿尔梅达,R.M.C。;Iglesias,J.R.,生物组织中的有丝分裂和生长,《物理学》。E版,48、1、598-602(1993年) [35] 蒙罗,E.M。;Odell,G.M.,海鞘脊索内陷和会聚延伸的基础上的极化基底外侧细胞运动,《发育》,129,13-24(2002) [36] 罗杰斯,G。;Goel,N.S.,细胞运动的计算机模拟,细胞分类,细胞通过大量细胞的迁移和接触抑制,J.theor。生物学,71,1,141-166(1978) [37] 萨维尔,N。;Hogeweg,P.,《从单个细胞到爬行蛞蝓的形态发生建模》,J.theor。《生物学》,184,3229-235(1997) [38] 施,J。;Keller,R.,细胞运动驱动外植体的内侧插入非洲爪蟾《发展》,116,4901-914(1992) [39] Shih,J。;Keller,R非洲爪蟾具有组织者属性《发展》,116,4887-899(1992) [40] Smith,L.,1984年。线性代数第二版,数学本科生教材。纽约州施普林格。;Smith,L.,1984年。线性代数第二版,数学本科生教材。纽约州施普林格。 [41] Steinberg,M.S.,《关于游离细胞重建组织的机制》,III.自由能关系和融合异质组织碎片的重组,Proc。美国国家科学院。科学。美国,48,101769-1776(1962) [42] Steinberg,M.S.,《关于游离细胞重建组织的机制》,I.群体动力学、差异粘附性和无定向迁移,Proc。美国国家科学院。科学。美国,48,9,1577-1582(1962) [43] 斯坦伯格,M.S.,《用游离细胞重建组织》,《科学》,141,3579,401-408(1963) [44] Steinberg,M.S.,《用分离的细胞重建组织》(Mostow,G.D.,《细胞重排的数学模型》(1975),耶鲁大学出版社:耶鲁大学出版公司,康涅狄格州纽黑文),82-99,(第6章)·Zbl 0308.92001号 [45] 斯托特,E.L。;北佛罗里达州布里顿。;Glazier,J.A。;Zajac,M.,使用Potts模型随机模拟良性无血管肿瘤生长,数学。计算。型号。,30, 183-198 (1999) [46] Upadhyaya,A.,2000年。细胞、组织和膜的热力学和流体性质。印第安纳州圣母大学博士论文。;Upadhyaya,A.,2000年。细胞、组织和膜的热力学和流体性质。印第安纳州圣母大学博士论文。 [47] 韦利基,M。;明苏克,S。;凯勒,R。;Oster,G.,《诺特科德形态发生》非洲爪蟾组织会聚和延伸的细胞行为模拟,Development,113,4,1231-1244(1991) [48] 温克尔鲍尔,R。;Nagel,M.,中胚层细胞在原肠非洲爪蟾《发展生物学》,148573-589(1991) [49] Wolpert,L。;贝丁顿,R。;布罗克斯,J。;Jessel,T。;Peter,L。;Meyerowitz,E.,《发展原则》(1998),牛津大学出版社:牛津大学出版社,纽约 [50] Zajac,M.,2002年。通过各向异性微分粘着模拟收敛扩展。印第安纳州圣母大学博士论文。;Zajac,M.,2002年。通过各向异性微分粘着模拟收敛扩展。印第安纳州圣母大学博士论文。 [51] Zajac,M。;Jones,G.L。;Glazier,J.A.,动物形态发生的会聚延伸模型,物理学。修订稿。,85, 9, 2022-2025 (2000) 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配,可能包含数据转换错误。在某些情况下,zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献,而不要求完整或完全匹配。