埃里克·博茨科。;托马斯·基迪恩;克里斯·斯托尔斯(Chris C.Stowers)。;Todd R.扬。 酵母细胞周期动力学和聚类的ODE、RDE和SDE模型。 (英语) Zbl 1342.92119号 生物学杂志。动态。 4,第4号,328-345(2010). 摘要:生物学家长期以来观察到酵母种群在一定条件下的周期性耗氧振荡,并对这一现象提出了一些令人不满意的解释。这些“自主振荡”通常出现的周期几乎是文化计算倍增时间的整数除数。我们假设这些振荡可能是由一种称为集群的细胞周期同步引起的。我们开发了一些新的细胞周期常微分方程模型。对于这些模型以及随机和随机扰动,我们给出了严格的证明和模拟,表明细胞周期内的正增长率和负增长率反馈都是可能导致细胞周期内种群聚集的因素。它适用于各种模型和广泛的参数值选择。这些结果表明,聚类现象是稳健的,很可能在自然界中观察到。由于簇数必须为整数,因此簇集会导致周期性行为,其周期几乎是细胞周期的整数除数。相关实验已明确表明,某些振荡酵母培养物中存在细胞周期聚集现象。 引用于14文件 MSC公司: 92C99型 生理、细胞和医学主题 关键词:自主振荡;细胞周期;芽殖酵母 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{E.M.Boczko}等人,J.Biol。动态。4,第4号,328--345(2010;Zbl 1342.92119) 全文: 内政部 arXiv公司 链接 参考文献: [1] DOI:10.1016/j.mbs.2005.03.010·Zbl 1071.92032号 ·doi:10.1016/j.mbs.2005.03.010 [2] DOI:10.1128/MCB.00719-07·doi:10.1128/MCB.00719-07 [3] Arnold L.,随机动力系统(1998)·Zbl 0906.34001号 [4] 内政部:10.1146/annurev.genet.39.110304.095808·doi:10.1146/annurev.genet.39.110304.095808 [5] 内政部:10.1142/9781860949920_0009·doi:10.1142/9781860949920_0009 [6] DOI:10.1016/S0168-1656(98)00016-9·doi:10.1016/S0168-1656(98)00016-9 [7] Boye,E.,Stokke,T.,Kleckner,N.和Skarstad,K.,1996年。协调DNA复制起始与细胞生长:DnaA和SeqA蛋白的不同作用。程序。国家。阿卡德。科学。1996年,第93卷,第12206-12211页。 [8] Brewer B.J.,分子细胞。生物4第2529页–(1984)·doi:10.1128/MCB.4.11.2529 [9] Chen,H.、Fujita,M.、Feng,Q.、Clardy,J.和Fink,G.R.,2004年。酪氨醇是白色念珠菌的群体感应分子。程序。国家。阿卡德。科学。2004年,第101卷,第5048–5052页。 [10] DOI:10.1091/mbc。E03-11-0794号·doi:10.1091/mbc。E03-11-0794号 [11] DOI:10.1126/科学.1140958·doi:10.1212/科学1140958 [12] Collier,J.、McAdams,H.H.和Shapiro,L.,2007年。DNA甲基化棘轮通过细菌细胞周期控制细胞周期的进展。程序。国家。阿卡德。科学。2007年,第104卷,第17111–17116页。 [13] 内政部:10.1137/050640072·Zbl 1210.37033号 ·数字对象标识代码:10.1137/050640072 [14] 内政部:10.1137/050648055·Zbl 1197.76164号 ·doi:10.1137/050648055 [15] DOI:10.1146/anurev.micro.51.1.527·doi:10.1146/annurev.micro.51.1.527 [16] DOI:10.1186/gb-2006-7-4-107·doi:10.1186/gb-2006-7-4-107 [17] 内政部:10.1016/0040-5809(84)90035-2·兹比尔0551.92016 ·doi:10.1016/0040-5809(84)90035-2 [18] Hartwell L.H.,《细菌学》。第38版,第164页–(1974) [19] 内政部:10.1083/jcb.77.3.627·doi:10.1083/jcb.77.3.627 [20] 数字对象标识码:10.1038/nrmicro1600·doi:10.1038/nrmicro1600 [21] DOI:10.1016/j.compchemeng.2004.08.018·doi:10.1016/j.compchemeng.2004.08.018 [22] 内政部:10.1016/0009-2509(94)85081-X·doi:10.1016/0009-2509(94)85081-X [23] 内政部:10.1016/0168-1656(95)00086-6·doi:10.1016/0168-1656(95)00086-6 [24] DOI:10.1070/RD2006v011n02ABEH000348·Zbl 1164.34402号 ·doi:10.1070/RD2006v011n02ABEH000348 [25] 内政部:10.1128/AEM.67.7.2982-2992.2001·doi:10.1128/AEM.67.7.2982-2992.2001 [26] 数字对象标识码:10.1002/位260390313·doi:10.1002/位260390313 [27] 内政部:10.1016/0014-4827(77)90154-9·doi:10.1016/0014-4827(77)90154-9 [28] DOI:10.1016/S0168-1656(99)00017-6·doi:10.1016/S0168-1656(99)00017-6 [29] DOI:10.1016/j.cub.2004.11.027·doi:10.1016/j.cub.2004.11.027 [30] DOI:10.1126/science.1070850·doi:10.1126/science.1070850 [31] DOI:10.1023/A:1017909012215·doi:10.1023/A:1017909012215 [32] DOI:10.1016/j.肽.2003.11.026·doi:10.1016/j.肽.2003.11.026 [33] DOI:10.1103/PhysRevE.59.4062·doi:10.1103/PhysRevE.59.4062 [34] 内政部:10.1063/1.2967806·Zbl 1309.34056号 ·数字对象标识代码:10.1063/1.2967806 [35] DOI:10.1002/年967·doi:10.1002/年967 [36] DOI:10.1016/S0014-4827(03)00068-5·doi:10.1016/S0014-4827(03)00068-5 [37] Palkova Z.,J.细胞科学。第113页,1923–(2000) [38] Robertson,J.B.、Stowers,C.、Boczko,E.M.和Johnson,C.H.,2008年。酵母细胞周期和代谢振荡的实时发光监测。程序。国家。阿卡德。科学。2008年,第105卷,第17988–17993页。 [39] 内政部:10.1016/0022-5193(77)90179-5·doi:10.1016/0022-5193(77)90179-5 [40] Singer,R.A.和Johnston,G.C.,1981年。酿酒酵母G1期的性质。程序。国家。阿卡德。科学。1981年,第78卷,第3030-3033页。 [41] 数字对象标识码:10.1073/pnas.70.4.1263·doi:10.1073/pnas.70.4.1263 [42] 数字对象标识码:10.1007/s12010-008-8486-7·doi:10.1007/s12010-008-8486-7 [43] 斯托尔斯C.,Theor。大众。生物。 [44] Sun,J.、Li,D.、Stowers,C.和Boczko,E.M.,2008年。用基于mosfet的微流控库尔特计数器测量芽殖酵母生长速率。IMECE2008 69098 Boston会议记录。2008年,美国马萨诸塞州。 [45] 内政部:10.1126/科学1120499·doi:10.1126/科学.1120499 [46] DOI:10.1016/S0022-5193(86)80162-X·doi:10.1016/S0022-5193(86)80162-X [47] Woldringh C.L.,《细菌学杂志》。第175页,第3174页–(2003年)·doi:10.1128/jb.175.10.3174-3181.1993年 [48] Zadrag R.,学报。生物化学。波兰。第53页,第747页–(2006年) [49] DOI:10.1016/S0009-2509(00)00208-6·doi:10.1016/S0009-2509(00)00208-6 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配,可能包含数据转换错误。在某些情况下,zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献,而不要求完整或完全匹配。