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利用零膨胀广义泊松回归定位多个相互作用的数量性状位点。 (英语) Zbl 1304.92086号

小结:我们考虑了定位多个相互作用的数量性状位点(QTL)的问题,这些QTL影响以计数衡量的性状。在许多应用中,计数变量的分布峰值为零。零膨胀广义泊松回归(ZIGPR)允许在零处增加一个概率质量,从而改进了重要位点的检测。经典模型选择标准往往高估了QTL数量。因此,贝叶斯信息准则(mBIC和EBIC)的修改版本被成功用于QTL定位。我们基于ZIGPR以及更简单的模型应用这些标准。大量的仿真研究表明,它们在控制错误发现率的同时,具有良好的QTL检测能力。我们说明了泊松分布无法解释过度分散是如何导致QTL数被高估的,因此强烈阻碍了它在识别影响计数数据的因素方面的应用。该方法用于分析以往工作的小鼠胆结石数据。我们的结果表明,4号染色体上存在一个新的QTL,该QTL与之前在5号染色体上发现的另一个QTL相互作用。我们在R中提供了相应的代码。

MSC公司:

92D10型 遗传学和表观遗传学
62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用;元分析

软件:

R(右)
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全文: 内政部