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使用马尔可夫链蒙特卡罗直接从单通道记录中对离子通道选通机制进行贝叶斯推断。 (英语) Zbl 1063.62586号

摘要:单离子通道的选通机制通常由有限状态空间连续时间马尔可夫链建模。拼接灯技术使实验者能够记录流经单离子通道的电流。在实际中,电流受到噪声和低通滤波的影响,采样间隔通常很短。我们提出了一种方法,用于直接从此类单通道记录中对控制底层单通道选通机制和记录过程的参数进行贝叶斯推断。我们的过程使用了一种称为马尔可夫链蒙特卡罗(Markov chain Monte Carlo)的技术,该技术包括构造一个马尔可夫链式,其平衡分布由给定观测数据的未知参数的后验分布给出。然后对马尔可夫链进行模拟,使研究人员能够估计所需的后验分布。除了提供一种估计用于建模单通道门控机制的潜在马尔可夫链的转换速率以及开电导和闭电导水平的均值和方差的方法外,我们的马尔可夫链蒙特卡罗模拟的输出还可以用于估计单通道特性,例如打开和关闭逗留时间的平均长度,并重建指示通道是打开还是关闭的未观察到的量子信号。主要从离子通道文献中获得的几个数值例子说明了这一理论。

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62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用;元分析
2015年1月62日 贝叶斯推断
65立方厘米 马尔可夫链的数值分析或方法
92C30型 生理学(一般)
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全文: 内政部