普兰贾尔·阿瓦西;阿夫林·布鲁姆;杰米·摩根斯坦;谢菲特,或 近完美系统发育构建的加性近似。 (英语) 兹比尔1358.68317 Gupta,Anupam(编辑)等人,《近似、随机化和组合优化》。算法和技术。第15次国际研讨会,APPROX 2012,第16次国际研讨会,RANDOM 2012,美国马萨诸塞州剑桥,2012年8月15日至17日。诉讼程序。柏林:施普林格出版社(ISBN 978-3-642-32511-3/pbk)。计算机科学课堂讲稿7408,25-36(2012)。 摘要:我们研究了为一组给定物种构建系统发育树的问题。该问题被表述为在维数为(d)的布尔超立方体上的(n)点上寻找最小Steiner树的问题。众所周知,最优树可以在线性时间内找到[.丁等,Lect。注释计算。科学。3500,勒克图。生物信息学笔记,585-600(2005;Zbl 1119.92350号)]如果给定的数据集具有完美的系统发育,即最佳系统发育的成本正好是\(d)。此外,如果数据具有接近完美的系统发育,即最优Steiner树的代价为(d+q),则已知[G.E.Blelloch公司等,Lect。注释计算。科学。4051, 667–678 (2006;Zbl 1223.68053号)]在运行时间中可以找到一个精确的解,它是物种数和(d)的多项式,而在(q)中是指数的。在这项工作中,我们给出了一个多项式时间算法(在(d)和(q)中),它可以找到代价为(d+O(q^{2})的系统发育树。这提供了已知的最佳保证,即,对于情况(log(d)\ll-q\ll\sqrt{d}),a \((1+o(1))\)-近似,拓宽了可以有效找到近最优解决方案的设置范围。我们还讨论了研究这种加性近似的动机和推理。有关整个系列,请参见[Zbl 1248.68036号]. MSC公司: 68周25 近似算法 92D15型 与进化有关的问题 引文:Zbl 1119.92350号;Zbl 1223.68053号 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{P.Awasthi}等人,Lect。注释计算。科学。7408,25-36(2012;Zbl 1358.68317) 全文: 内政部 arXiv公司