兰格,K。;周,D.E。 有效计算lod分数:基因型消除、基因型重新定义和混合最大似然算法。 (英语) Zbl 0663.92009号 安。嗯。遗传学。 53,第1号,67-83(1989). 多点lod分数的计算在数值分析、组合学、编程和遗传学中提出了具有挑战性的问题。通过利用由核心家庭加上所有四位祖父母组成的CEPH型谱系的简单谱系结构,可以加速这些计算。G.M.Lathrop公司,J.M.拉鲁埃尔和R.L.怀特【遗传学流行病学3,39-52(1986)】引入了似然因子分解和转换规则E.S.Lander公司和P.绿色【Proc.Natl.Acad.Sci.USA 84,2363-2367(1987)】采用“隐马尔可夫链”方法。本文探索了一种基于祖父母基因型重新定义和所有谱系成员系统相位消除的替代方法。这三种方法都加快了单个可能性的计算。与多点映射同样相关的是寻找重组分数最大似然估计的搜索策略。以EM算法开始并中途转换为准牛顿算法的混合算法显示出了前景。这些问题是在一个模拟的10个基因座的例子中进行研究的。同一个例子使我们能够说明一种确定基因座顺序的简单策略。 引用于2文件 MSC公司: 92D10型 遗传学和表观遗传学 62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用;元分析 65C99个 概率方法,随机微分方程 关键词:多焦点lod分数的计算;CEPH型系谱;重组分数的最大似然估计;混合算法;EM算法;拟纽顿算法 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{K.Lange}和\textit{D.E.Weeks},Ann。Hum。Genet。53,第1号,67--83(1989;Zbl 0663.92009) 全文: 内政部 参考文献: [1] DOI:10.1073/pnas.84.22.8006·doi:10.1073/pnas.84.22.8006 [2] L.L.Cavalli-Sforza和W.F.Bodmer(1971)。《人类群体遗传学》,第882页,公式83。旧金山:W.H.Freeman。 [3] Dempster S.P.、J.Roy。Stat.Soc.(Lond.Ser.B)39第1页–(1977年) [4] 内政部:10.1137/1019005·Zbl 0356.65041号 ·doi:10.1137/1019005 [5] 内政部:10.1016/0092-8674(87)90158-9·doi:10.1016/0092-8674(87)90158-9 [6] DOI:10.1146/anurev.bb.08.060179.001211·doi:10.1146/annurev.bb.08.060179.001211 [7] Lalouel J.M.,《遗传》38(1),第61页–(1977年) [8] DOI:10.1073/pnas.84.8.2363·doi:10.1073/pnas.84.8.2363 [9] 兰格·K,嗯,这里。第33页,291页–(1983年) [10] 兰格·K,嗯,这里。第25页,95–(1975) [11] Lange K.,Am.J.Hum.遗传学。第40页,第250页–(1987年) [12] Lange K.,IEEE医学成像汇刊6第106页–(1987) [13] Lange K.,系谱分析程序。生物数学系(1987) [14] Lathrop G.M.,Am.J.Hum.遗传学。第42页,498页–(1988年) [15] 内政部:10.1002/gepi.1370030105·doi:10.1002/表1370030105 [16] Leppert M.,Am.J.Hum.遗传学。第39页,第425页–(1986年) [17] Lewitt R.M.,《IEEE医学成像汇刊》第5卷第16页–(1986年) [18] P.M.Mamelka、B.Dyke和J.W.MacCluer(1987年)。苹果Macintosh的谱系/绘图。西南生物医学研究基金会,德克萨斯州圣安东尼奥。 [19] 内政部:10.1016/0888-7543(87)90110-8·doi:10.1016/0888-7543(87)90110-8 [20] Ott J.,Am.J.Hum.遗传学。第26页,588页–(1974年) [21] 奥特·J·安·嗯·遗传学。第40页,第443页–(1977年) [22] 奥特·J·安·嗯·遗传学。第42页,第255页–(1978) [23] Ott J.,Am.J.Hum.遗传学。第31页,161页–(1979年) [24] C.R.Rao(1973)。线性统计推断及其应用,第2版,第385-389页。纽约:Wiley。 [25] 内政部:10.1137/1026034·Zbl 0536.62021号 ·数字对象标识代码:10.1137/1026034 [26] 史密斯·C·A·B,安·嗯·遗传学。第21页,第254页–(1957年) [27] DOI:10.1093/imammb/1.1.31·doi:10.1093/imammb/1.1.31 [28] 内政部:10.1016/0888-7543(87)90050-4·doi:10.1016/0888-7543(87)90050-4 [29] 内政部:10.1038/313101a0·数字对象标识代码:10.1038/313101a0 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配,可能包含数据转换错误。在某些情况下,zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献,而不要求完整或完全匹配。