Vikram博士Sunkara

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AA1-19候选药物在化学空间中扮演Pareto Optima

寻找同时具有高效作用、符合规定的化学性质、且显示出低离靶效应的新型候选药物可以。。。

AA1-19候选药物在化学空间中扮演Pareto Optima

$数学+AA1-20$

单细胞RNA速度建模的几何学习

生物细胞经历状态转换，可通过单细胞RNA测序进行测量。RNA速度估计基因表达变化率，形成速度载体。。。

用于单细胞RNA速度建模的几何学习

数学驱动药物设计

该项目旨在围绕药物设计数学创造一个数学+成功故事。它提出了一种新的G蛋白偶联受体药物设计策略。。。

数学驱动药物设计

出版物

2023

模拟炎症环境中G蛋白偶联受体的信号改变以促进药物设计 科学报告，13（607），2023 阿恩·蒂斯，维克拉姆·桑卡拉Sourav Ray、Hanna Wulkow、M.zgür Celik、Fatih Yergöz、，克里斯托夫·舒特克里斯托夫·斯坦因，马库斯·韦伯,斯蒂芬妮·温克尔曼 BibTeX公司
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基于ReLU的深度神经网络的激活空间 《Procedia Computer Science》，第624-635页，第222卷，2023年穆斯塔法·肖凯尔,克里斯托夫·舒特,维克拉姆·桑卡拉 BibTeX公司
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2022

随机流体流动过程平稳分布的间断Galerkin逼近方法 2022年应用概率的方法和计算维克拉姆·桑卡拉、安格斯·刘易斯、Giang T.Nguyen、Malgorzata M.O'Reilly、奈杰尔·比恩 BibTeX公司
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Chimeric U-Net–修改标准U-Net以实现可解释性 bioRxiv，2022年（审查中）肯里克·舒尔茨、菲利克斯·佩佩特、，克里斯托夫·舒特,维克拉姆·桑卡拉 BibTeX公司
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利用深卷积神经网络求解间隙填充问题的充分条件 IEEE神经网络和学习系统汇刊，33（11），pp.6194-62052022 费利克斯·佩佩特（Felix Peppert）、马克斯·冯·克莱斯特（Max von Kleist）、，克里斯托夫·舒特,维克拉姆·桑卡拉 BibTeX公司
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人软骨细胞颗粒培养单细胞序列测定管道，以确定IL-1β调节的细胞异质性变化 骨关节炎和软骨，30（增补1），p.S902022 Annemarie Lang、Antja Vester、M.Ferreira-Gomes、G.M.Guerra、Fredrich R.Heinrich、C.C.Gotzke、Sebastian Kurmies、，维克拉姆·桑卡拉巴维尔·杜雷克、乔尔·博克尔、米尔·法津·马什利吉 BibTeX公司
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理解罗马化在突尼斯北部地区间历史网络上的传播 应用网络科学，2022年第7卷（预印本可作为ZIB报告22-10获得）玛格丽塔·科斯特雷,维克拉姆·桑卡拉,克里斯托夫·舒特,纳塔萨·朱尔德杰瓦克·康拉德 PDF格式（ZIB-报告）
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用胶囊网络在低温电子断层图中识别体积大分子 BMC生物信息学，23（360），2022 努申·哈哈拉斯瓦迪,维克拉姆·桑卡拉萨加尔·卡夫内卡、弗洛里安·贝克、罗伯特·勃兰特，丹尼尔·鲍姆 BibTeX公司
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2021

结合节段性体细胞和单细胞RNA测序确定小鼠膝关节软骨细胞基因表达特征 骨关节炎和软骨，29（6），第905-9142021页维克拉姆·桑卡拉、吉塔·海因茨、弗雷德里克·海因里希、帕维尔·杜雷克、阿里·莫巴舍里、米尔·法津·马什雷吉、安娜玛丽·朗 BibTeX公司
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基于重心坐标和记忆的非线性动力学数据驱动建模 《统计物理学杂志》。，2021年（审查中）尼古拉斯·沃尔科夫佩特·科尔泰，维克拉姆·桑卡拉,克里斯托夫·舒特 BibTeX公司
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历史影响网络推断 复杂网络及其应用国际会议论文集，pp.110-1132021 玛格丽塔·科斯特,维克拉姆·桑卡拉,纳塔萨·朱尔德杰瓦克·康拉德 BibTeX公司
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根据Synodal文本之间的统计关系模式推断文化和社会过程 2021年（进行中）拉尔夫·伯克，N.Alexia Raharinirina公司,康斯坦丁·法克尔迪托尼奥·塞巴斯蒂安·里希特，马库斯·韦伯 BibTeX公司

从单细胞RNA-seq时间快照数据推断基因调控网络需要高阶矩 图案，2（9），2021（预印本作为ZIB报告20-25提供） Alexia N.Raharinirina、Felix Peppert、Max von Kleist、，克里斯托夫·舒特,维克拉姆·桑卡拉 PDF格式（ZIB-报告）
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模拟炎症环境中G蛋白偶联受体的信号传导改变以推进药物设计 ZIB-报告21-19 Sourav Ray、Arne Thies、，维克拉姆·桑卡拉Hanna Wulkow、Ozür Celik、Fatih Yergöz、，克里斯托夫·舒特克里斯托夫·斯坦因，马库斯·韦伯,斯蒂芬妮·温克尔曼 PDF格式
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2020

结合节段性体细胞和单细胞RNA测序确定小鼠膝关节软骨细胞基因表达特征 biorarxiv（接受于Osteoarthr.Cartil.），2020年维克拉姆·桑卡拉、吉塔·海因茨、弗雷德里克·海因里希、帕维尔·杜雷克、阿里·莫巴舍里、米尔·法津·马什雷吉、安娜玛丽·朗 BibTeX公司
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HIF-稳定可防止骨折延迟愈合 biorarxiv，2020年（审查中）安娜玛丽·朗、莎拉·赫尔夫梅尔、乔纳森·斯特凡诺夫斯基、阿迪蒂·库佩、，维克拉姆·桑卡拉，Moritz Pfeffenberger，Angelique Wolter，Alexandra Damerau，Shabnam Hemmati Sadeghi，Jochen Ringe，Rainer Haag，Anja E.Hauser，Max Löhning，Carsten Perka，Georg Duda，Paula Hoff，Katharina Schmidt Bleek，Timo Gaber，Frank Buttgereit BibTeX公司
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如何基于不同结合基序的热力学模拟计算受体-受体系统的pH-相关结合率 分子模拟，46（18），第1443-1452页，2020年（预印本见ZIB-Report 20-18） Sourav Ray，维克拉姆·桑卡拉,克里斯托夫·舒特,马库斯·韦伯 PDF格式（ZIB-报告）
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单分子多碘受体膜动力学以超分辨精度揭示激动剂特异性二聚体的形成 《自然化学生物学》，第16卷，第946-954页，2020年 Jan Möller、Ali Isbilir、Titiwat Sungkaworn、Brenda Osberg、Christos Karathanasis、，维克拉姆·桑卡拉尤金·奥·格鲁舍夫斯基、安德烈亚斯·博克、保罗·安妮贝尔、迈克·海勒曼，克里斯托夫·舒特，Martin J.Lohse BibTeX公司
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感染和有丝分裂传播对HTLV-1持久性的相对贡献 2020年PLOS计算生物学 Daniel J.Laydon，维克拉姆·桑卡拉、Lies Boelen、Charles R.M.Bangham、Becca Asquith BibTeX公司
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2019

基因调控网络中条件期望的代数表达 《数学生物学杂志》，第1779-18292019页维克拉姆·桑卡拉 PDF格式
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鉴别手术诱导OA小鼠模型的时空疾病模式 PLOS One，2019年14（4）日托拜厄斯·哈斯，维克拉姆·桑卡拉、本杰明·科尔、卡罗拉·梅耶、帕特里夏·布伊曼、杰西卡·贝克尔、米查尔·贾吉尔斯基、马克斯·冯·克莱斯特、沃尔夫冈·埃特尔 BibTeX公司
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关于反应计数化学主方程的性质 熵，21（6），第607页，2019年维克拉姆·桑卡拉 BibTeX公司
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内侧半月板横断诱导的骨关节炎中雄性和雌性小鼠的疼痛和膝关节损伤 2019年骨关节炎和软骨 Julia Temp、Dominika Labuz、Roger Negrete、，维克拉姆·桑卡拉哈利娜·马切尔斯卡 BibTeX公司
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SLCV–一种监督学习-计算机视觉组合策略，用于横截面图像中的自动肌纤维检测 2019年同行杂志 Anika Rettig、Tobias Haase、Alexandr Pletnyov、Benjamin Kohl、Wolfgang Ertel、Max von Kleist、，维克拉姆·桑卡拉 PDF格式
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