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蛋白质

高迁移率族蛋白B1

基因

HMGB1

有机体
智人(人类)
状态
检验过的-批注分数:

注释得分:5分共5页

<p>注释分数提供了UniProtKB条目或蛋白质组注释内容的启发式度量。由于我们无法为任何给定的蛋白质定义“正确的注释”,因此该分数不能</strong>用于衡量注释的准确性。<p><a href='/help/annotation_score'target=''u top'>更多</a></p>
-蛋白质水平的实验证据<p>这表明了支持蛋白质存在的证据类型。请注意,“蛋白质存在”证据并不提供显示序列的准确性或正确性的信息。<p><a href='/help/protein\'existence'target=''u top'>更多</a></p>

<p>本节提供有关蛋白质的任何有用信息,主要是生物学知识</a></p>功能

多功能氧化还原敏感蛋白,在不同的细胞室中有不同的作用。细胞核是一种主要的染色质相关非组蛋白,在复制、转录、染色质重构、V(D)J重组、DNA修复和基因组稳定性等方面起着DNA伴侣的作用(参考文献71). 提出了一种通用的核酸生物传感器。促进宿主对无菌和感染性信号的炎症反应,参与先天性和适应性免疫反应的协调和整合。在细胞质中,作为免疫原性核酸的传感器和/或伴侣,激活TLR9介导的免疫反应,并介导自噬。作为危险相关分子模式(DAMP)分子,在组织损伤期间增强免疫反应(PubMed:27362237). 释放到细胞外环境中可结合DNA、核小体、IL-1β、CXCL12、AGER亚型2/sAge、脂多糖(LPS)和脂磷壁酸(LTA),并通过多种表面受体的参与激活细胞。在细胞外小室中,完全还原的HMGB1(坏死释放)作为趋化因子,二硫化物HMGB1(主动分泌)作为细胞因子,磺酰HMGB1(从凋亡细胞释放)促进免疫耐受(PubMed:23519706,公共医疗:23446148,公共医疗:23994764,公共医疗:25048472). 具有促血管生成活性(相似)。可能与血小板活化有关(相似)。与磷脂酰丝氨酸和磷脂酰乙醇酰胺结合(相似)。绑定到RAGE介导神经元生长的信号(通过相似性)。聚葡聚糖在聚谷氨酰胺(tbhtp)的积累中可能起作用:23303669,公共医疗:25549101).相似性4种出版物4种出版物
核功能归因于HGMB1的完全还原。与染色质结合,优先结合非标准DNA结构,如单链DNA、含有十字形或弯曲结构的DNA、超螺旋DNA和ZDNA。可以弯曲DNA并通过循环增强DNA的灵活性,从而提供了一种机制,通过增强转录因子结合和/或使远处的调控序列靠近来促进各种基因启动子上的活性(PubMed:20123072). 可能在核苷酸切除修复(NER)中具有增强作用(通过相似性)。然而,使用体外系统对内质网的影响有矛盾的报道(PubMed:19446504,公共医疗:19360789). 可能参与错配修复(MMR)和基底切除修复(BER)途径(PubMed:15014079,公共医疗:16143102,公共医疗:17803946). 可能涉及双链断裂修复,如非同源端接(NHEJ)(通过相似性)。作为RAG复合物的辅因子参与V(D)J重组:通过刺激保守重组信号序列(RSS)23bp间隔区的裂解和RAG蛋白结合(通过相似性)。在体外可以从高度弯曲的DNA中置换组蛋白H1(通过相似性)。能重组典型核小体,导致转录因子结合的结构约束松弛(通过相似性)。增强固醇调节元件结合蛋白(SREBPs)如SREBF1与其同源DNA序列的结合,并增加其转录活性(通过相似性)。促进TP53与DNA的结合(PubMed:23063560). 建议以转录依赖方式参与线粒体质量控制和自噬,涉及HSPB1;然而,这种功能受到了质疑(相似性)。可以调节端粒酶复合物的活性,并可能参与端粒的维持(通过相似性)。相似性2个出版物5种出版物
在细胞质中,通过与BECN1的竞争性相互作用分解BECN1:BCL2复合物,导致自噬激活(PubMed:20819940). 参与氧化应激介导的自噬(PubMed:21395369). 可以保护BECN1和ATG5不受calpain介导的分裂的影响,因此建议控制它们的促自噬和促凋亡功能,并调节炎症相关细胞损伤的程度和严重程度(通过相似性)。髓系细胞通过促进自噬(通过相似性)对内毒素血症和细菌感染具有保护作用。与巨噬细胞内CpG DNA反应时TLR9的内质易位和活化有关(通过相似性)。相似性2个出版物
在细胞外室(主动分泌或被动释放后)参与炎症反应的调节。在组织损伤的初始阶段,与CXCL12相关的完全降低的HGMB1(释放后随后氧化)介导炎症细胞的募集;CXCL12:HMGB1复合物触发CXCR4同源二聚体(PubMed:22370717). 诱导单核细胞来源的未成熟树突状细胞的迁移,并似乎调节中性粒细胞的粘附和迁移功能,包括AGER/RAGE和ITGAM(通过相似性)。可与包括微生物非甲基化CpG-DNA在内的多种DNA和RNA结合,增强对核酸的天然免疫反应。被提议在混杂的DNA/RNA传感中起作用,它与随后由特定的模式识别受体(通过相似性)进行的鉴别感测相配合。促进细胞外DNA诱导的AIM2炎症小体激活与AGER/RAGE相关(PubMed:24971542). 二硫化物HMGB1与跨膜受体结合,如AGR/RAGE、TLR2、TLR4和可能的TREM1,从而激活它们的信号转导途径。介导细胞因子/趋化因子的释放,如TNF、IL-1、IL-6、IL-8、CCL2、CCL3、CCL4和CXCL10(PubMed:12765338,公共医疗:18354232,公共医疗:19264983,公共医疗:20547845,公共医疗:24474694). 促进巨噬细胞刺激的自然杀伤细胞(NK)分泌干扰素γ,与其他细胞因子如IL-2或IL-12(PubMed:15607795). TLR4被认为是促进巨噬细胞活化的主要受体,通过TLR4传递信号似乎与LY96/MD-2有关(PubMed:20547845). 在细菌中,LPS-或LTA介导的炎症反应与内毒素结合,并将其转移到CD14,以向相应的TLR4:LY96和TLR2复合物发出信号(PubMed:18354232,公共医疗:21660935,公共医疗:25660311). 与ACER/RAGE相关(通过相似性)促进肿瘤增殖。可与IL1β结合,并通过IL1R1:IL1RAP受体复合物(PubMed:18250463). 与A类CpG结合可激活包括TLR9、MYD88和AGER/RAGE的浆细胞样树突状细胞中细胞因子的产生,并能激活自身反应性B细胞。含HMGB1的染色质免疫复合物也可能通过B细胞受体(BCR)依赖和ACER/RAGE非依赖机制(通过相似性)促进B细胞对内源性TLR9配体的反应。抑制巨噬细胞吞噬凋亡细胞;该功能依赖于聚ADP核糖基化,并与凋亡细胞表面的磷脂酰丝氨酸结合(相似)。在适应性免疫中,通过激活效应T细胞和抑制调节性T(TReg)细胞(PubMed:15944249,公共医疗:22473704). 相反,在不影响效应或调节性T细胞的情况下,肿瘤浸润和激活表达淋巴毒素LTA:LTB异三聚体的T细胞,从而促进肿瘤恶性进展(通过相似性)。也有报道限制T细胞的增殖(通过相似性)。释放HMGB1:凋亡过程中形成的核小体复合物可通过TLR2发出信号,诱导细胞因子的产生(PubMed:19064698). 参与凋亡细胞诱导免疫耐受;凋亡细胞释放的促炎活性被活性氧(ROS)依赖的氧化作用中和,特别是Cys-106(PubMed:18631454). 在活化的淋巴细胞衍生自凋亡DNA(ALD-DNA)激活巨噬细胞时,促进ALD-DNA向内体的募集(通过相似性)。相似性16种出版物
(微生物感染)对人类冠状病毒SARS-CoV和SARS-CoV-2以及人类冠状病毒NL63/HCoV-NL63的进入至关重要。通过染色质调节调节前病毒基因ACE2和CTSL的表达。1个出版物

其他

提出有助于各种慢性炎症和自身免疫性疾病以及癌症的发病机制。血清高水平可见于多种炎症事件,包括败血症、类风湿性关节炎、动脉粥样硬化性慢性肾病、系统性红斑狼疮(SLE)。似乎与其他以细胞死亡和损伤为特征的疾病有关,包括糖尿病和老年痴呆症。其核小体在继发性坏死过程中的释放可能在SLE中起作用(PubMed:19064698). 化疗期间,以AGER/RAGE依赖的方式介导剩余细胞的再生和转移(PubMed:23040637). 纯化的HMG-box 1作为HGMB1促炎活性的特异性拮抗剂(PubMed:14695889).策划2个出版物

注意安全

不一致的实验结果可能反映了使用不一致的氧化还原形式。一种完全还原的重组形式已经在许多实验中被使用。然而,HMGB1在体内的氧化还原状态可能相互转换。纯化的HMGB1本身只有微弱的促炎活性。策划

区域

功能键职位说明行动图形视图长度
<p>本小节<a href=“http://www.uniprot.org/help/function%5Fsection“>函数</a>部分指定蛋白质中每个DNA结合域的位置和类型。<p><a href='/help/DNA_bind'target=''u top'>更多</a></p>DNA结合9 – 79HMG盒1PROSITE ProRule注释添加 爆炸71
DNA结合95 – 163HMG盒2PROSITE ProRule注释添加 爆炸69

<p><a href=http://www.geneology.org/“>Gene Ontology(GO)</a>项目提供了一组分为3类的分层控制词汇:<p><a href='/help/Gene\'u Ontology'target=''u top'>更多</a></p>GO-分子功能

GO-生物过程

<p>UniProtKB关键字构成a<a href=“http://www.uniprot.org/keywords“>有层次结构的受控词汇</a>。Keywords总结UniProtKB条目的内容,便于搜索感兴趣的蛋白质。<p><a href='/help/Keywords'target=''u top'>更多</a></p>关键词

分子功能DNA结合
生物过程适应性免疫,自噬,趋化性,DNA损伤,DNA重组,DNA修复,宿主病毒相互作用,免疫,炎症反应,先天免疫

酶和通路数据库

用于生物途径数据的Pathway Commons web资源

更多。。。
路路公地
P09429号

Reactome-生物途径和过程的知识库

更多。。。
反应途径
R-HSA-140342, 凋亡诱导DNA断裂
R-HSA-445989, TAK1通过磷酸化和激活IKKs复合物激活NFkB
R-HSA-5686938, 内源性配体对TLR的调节作用
R-HSA-6798695型, 粒作用
R-HSA-879415, 高级糖基化终产物受体信号转导
R-HSA-933542, TRAF6介导的NF-kB激活

信令网开放资源

更多。。。
签字人
P09429号

<p>本节提供有关蛋白质和基因名称、同义词以及作为蛋白质序列来源的有机体的信息</a></p>名称和分类法

<p>本小节<a href=“http://www.uniprot.org/help/names%5Fand%5Ftaxonomy%5Fsection“>名称和分类法</a>部分提供了从常用到过时的所有蛋白质名称的详尽列表,以便明确识别蛋白质。<p><a href='/help/protein\'target='></a></p>蛋白质名称
推荐名称:
高迁移率族蛋白B1
备选名称:
高迁移率族蛋白1
简称:
HMG-1型
<p>本小节<a href=“http://www.uniprot.org/help/names%5Fand%5Ftaxonomy%5Fsection序列中所描述的蛋白质(s)和序列(s)表示该基因(s)序列的名称。存在四个不同的标记:“Name”、“Synonyms”、“Ordered plantose names”和“ORF names”</a></p>基因名
姓名:HMGB1
同义词:HMG1型
<p>本小节<a href=“http://www.uniprot.org/help/names%5Fand%5Ftaxonomy%5Fsection“>名称和分类法</a>部分提供了作为蛋白质序列来源的有机体名称的信息。<p><a href='/help/organic name'target=''u top'>更多信息</a></p>有机体智人(人类)
<p>本小节<a href=“http://www.uniprot.org/help/names%5Fand%5Ftaxonomy%5Fsection“>名称和分类法</a>部分显示了NCBI分配给蛋白质源生物体的唯一标识符。这称为“分类标识符”或“taxid”。<p><a href='/help/taxonomic_identifier'target=''top'>更多</a></p>分类标识符9606[美国国立生物技术信息中心]
<p>本小节<a href=“http://www.uniprot.org/help/names%5Fand%5Ftaxonomy%5Fsection“>名称和分类法</a>部分包含源生物的分类等级分类谱系。它按节点在分类树中自上而下的方式列出节点,首先列出更一般的分组</a></p>分类谱系真核生物后生动物脊索动物头盖骨脊椎动物真肠造口术哺乳动物真神灵长总目灵长类哈普洛希尼狭鼻类人科人类
<p>本小节<a href=“http://www.uniprot.org/help/names%5Fand%5Ftaxonomy%5Fsection“>名称和分类法</a>部分用于a<a href=”http://www.uniprot.org/protemomes“>蛋白质组,例如,一组被认为是由基因组已完全测序的生物体表达的蛋白质</a></p>蛋白质组
  • UP000005640<p>单一保护<A href=“http://www.uniprot.org/manual/proteomes%5Fmanual“>蛋白质组</a>可由若干组分组成。<br></br>组分名称是指编码一组蛋白质的基因组组分。<p><a href='/help/proteome_component'target=''u top'>更多</a></p>组件:13号染色体

特定生物体数据库

人类基因命名数据库

更多。。。
HGNC公司
HGNC:4983, HMGB1

联机孟德尔人遗传(OMIM)

更多。。。
MIM公司
163905, 基因

下一步计划;人类蛋白质知识平台

更多。。。
下一步计划
新约P09429

真核病原体、载体和宿主数据库资源

更多。。。
韦帕德
主机数据库:ENSG0000189403.14

<p>本节提供有关成熟蛋白在细胞中的位置和拓扑结构的信息</a></p>亚细胞定位

关键词-细胞成分

细胞膜,染色体,细胞质,内体,,,秘密的

<p>本节提供与蛋白质相关的疾病和表型的信息</a></p>病理学与生物技术

突变

功能键职位说明行动图形视图长度
<p>本小节<a href=“http://www.uniprot.org/manual/physical%5Fand%5Fbiotech%5Fsection“>“病理学和生物技术”</a>部分描述了一种或多种氨基酸的实验性突变对蛋白质生物学特性的影响。<p><a href='/help/诱变剂'target=''u top'>更多</a></p>突变35S答:大大降低磷酸化,核定位;与A-39相关时;A-42;A-46;A-53和A-181。 1个出版物1
突变35S电子邮件:细胞质定位(模仿磷酸化);当与E-39相关时;E-42;E-46;E-53和E-181。 1个出版物1
突变39S答:大大降低磷酸化,核定位;与A-35相关时;42-A段;A-46;A-53和A-181。 1个出版物1
突变39S电子邮件:细胞质定位(模仿磷酸化);当与E-35相关时;E-42;E-46;E-53和E-181。 1个出版物1
突变42S答:大大降低磷酸化,核定位;与A-35相关时;A-39;A-46;A-53和A-181。 1个出版物1
突变42S电子邮件:细胞质定位(模仿磷酸化);当与E-35相关时;E-39;E-46;E-53和E-181。 1个出版物1
突变46S答:大大降低磷酸化,核定位;与A-35相关时;A-39;A-42;A-53和A-181。 1个出版物1
突变46S电子邮件:细胞质定位(模仿磷酸化);当与E-35相关时;E-39;E-42;E-53和E-181。 1个出版物1
突变53S答:大大降低磷酸化,核定位;与A-35相关时;A-39;A-42;A-46和A-181。 1个出版物1
突变53S电子邮件:细胞质定位(模仿磷酸化);当与E-35相关时;E-39;E-42;E-46和E-181。 1个出版物1
突变67D答:消除CASP1的切割作用并削弱抗凋亡诱导的免疫耐受的能力。 1个出版物1
突变106CS:抑制凋亡细胞中免疫刺激活性的氧化依赖性失活。 1个出版物1
突变181S答:大大降低磷酸化,核定位;与A-35相关时;A-39;A-42;A-46和A-53。 1个出版物1
突变181S电子邮件:细胞质定位(模仿磷酸化);当与E-35相关时;E-39;E-42;E-46和E-53。 出版物11

特定生物体数据库

不连续的

更多。。。
不连续的
3146

开放目标

更多。。。
开放目标
ENSG0000189403

药物遗传学和药物基因组学知识库

更多。。。
药剂师
PA188

杂项数据库

Pharos NIH药物基因组知识库

更多。。。
航标
P09429号, Tbio公司

化学数据库

生物活性药物类小分子数据库

更多。。。
化学
化学试剂2311236

药物和药物靶点数据库

更多。。。
药物数据库
DB00608号, 氯喹
DB05869号, 丙酮酸乙酯

遗传变异数据库

BioMuta管理的单核苷酸变异和疾病关联数据库

更多。。。
BioMuta公司
HMGB1

疾病突变(DMDM)的结构域定位

更多。。。
DMDM公司
123369

<p>本节介绍翻译后修改(ptm)和/或处理事件。<p><a href='/help/ptm_processing_section'target=''u top'>更多</a></p>PTM/处理

分子加工

功能键职位说明行动图形视图长度
<p>“PTM/加工”部分的这一部分描述了加工或蛋白水解裂解后成熟蛋白质中多肽链的范围。<p><a href='/help/chain'target=''u top'>更多</a></p>链条0000048526卢比1 – 215高迁移率族蛋白B1添加 爆炸215

氨基酸修饰

功能键职位说明行动图形视图长度
<p>“PTM/Processing”部分的这一小节指定了每个修改后残留物的位置和类型,不包括<a href=”http://www.uniprot.org/manual/lipid“>脂质</a>,<a href=“http://www.uniprot.org/manual/carbohyd“>聚糖</a>和<a href=”http://www.uniprot.org/manual/crosslnk“>蛋白质交叉链接</a></p>改性残渣N6乙酰赖氨酸相似性1
改性残渣7N6乙酰赖氨酸相似性1
改性残渣8N6乙酰赖氨酸相似性1
改性残渣12N6乙酰赖氨酸相似性1
<p>PTM/Processing“:/help/PTM_Processing_部分的这一小节描述了参与二硫键的半胱氨酸残基的位置。<p><a href='/help/disulfid'target='''u top'>更多</a></p>二硫键2345二硫化物HMGB1;候补相似性
改性残渣23半胱氨酸磺酸(-SO3H);候补相似性1
改性残渣28N6乙酰赖氨酸相似性1
<p>本小节<a href=“http://www.uniprot.org/help/ptm%5Fprocessing%5Fsection“>PTM/加工</a>部分描述了在两个蛋白质之间形成的不同类型的共价键(链间交联)</strong>或同一蛋白质的两个部分(链内交联)</strong>,除了在<a href=http://www.uniprot.org/manual/disulfid“>“二硫键”</a>小节。<p><a href='/help/crosslnk'target=''u top'>更多</a></p>交叉连接28异谷氨酰赖氨酸异肽(Lys-Gln)(与Q-?)间链1个出版物
改性残渣29N6乙酰赖氨酸相似性1
改性残渣30N6乙酰赖氨酸综合来源1
改性残渣35磷酸丝氨酸综合来源1
改性残渣43N6乙酰赖氨酸相似性1
交叉连接43异谷氨酰赖氨酸异肽(Lys-Gln)(与Q-?)间链1个出版物