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我能把基因符号转换成UnPurkb标识符吗?如何将UnPulkB ID或ACS映射到基因符号?

最后修改2018年4月10日

  1. UNIPROKB AC/ID到基因符号

    您可以将您的UnPosikB标识符(AC或ID)列表上传到批检索服务(“检索/ ID映射”)。然后点击链接“UnPultKB(XX)”(“XX”是你的结果中的条目数量),然后点击“列”来隐藏除基因名称之外的所有列。在结果页中,点击“下载”并选择制表分隔格式。仅显示推荐的基因名称(或仅同义词、有序的轨迹名称(OLN)或ORF名称),您可以编辑URL并替换“基因”下列之一:

    基因(优选)β基因(替代基因)(OLN)基因(ORF)

    参见:

  2. UnPotokb标识符的基因符号

    如果你的基因都来自一个有机体,有机体模型数据库,它与UnPurkb(例如HGNC,MGI,FielBASE)交叉引用,如果你有相应的远程数据库标识符,就可以为你的基因检索所有的UnPurkkb条目:你可以把这个列表上传到我们的服务器下。检索/标识映射并将该远程数据库的标识符映射到UnPultKB。

    参见:

    标识符映射服务也有一个选项“基因名称”,在这里您可以提交您的基因符号列表,并可选地指定有机体。注意,映射结果也可以在提交后过滤,例如通过有机体或审查/未审查状态。

    或者,为了检索与查询对应的所有条目,可以通过连接所有的基因名称来构建查询字符串。“或”并通过“基因:”“基因精确”:. 这可以用简单的脚本来完成,甚至可以在文本处理程序中使用“查找和替换”:

    Geang-Seime: BRAF或γ基因精确:BRCA1或γ基因精确:BRCA2或γ基因精确:BTK或γ基因精确:CSP10或γ基因精确:Casp8或γ等。

    用你的生物体标准来前缀,例如有机体:“智人”回顾:是的如果您希望限制您的结果审核UnPurkB/瑞士PROT条目,或者关键词:KW-1185限制于参考蛋白质组。

    有机体:“智人”和(GiangiStime:BRAF或GeNeGeime: BRCA1或GeNeGiele: BRCA2或GeNeOrthExp:BTK或GeNeGeLeave:Casp10或GeNeGeStime:CasP8)并复习:是的

    你可以使用“列”按钮定制您的结果表只显示基因名称和UNIPROKB标识符,然后下载表(见1)。以上)。

    使用长查询字符串,您可能会达到支持的查询字符串长度限制。如果遇到问题(例如空页),请考虑制作POST请求,或者拆分查询。

    参见:

UnPROT是灵丹妙药的核心数据资源
主要资金国立卫生研究院

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