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关于UniProt

最后修改2019年10月15日

通用蛋白质资源(UnPROT)是蛋白质序列和注释数据的综合资源。UnPROT数据库是UnPROT知识库(UnPrimkB), theUNIPRT参考簇(UNIRF)UnPROT档案馆(UNPARC). UNIPRT联盟和主机机构EMBL-EBI、SIB和PIR致力于UnPROT数据库的长期保存。

UnPROT是一种协作欧洲生物信息学研究所(EBL-EBI), the瑞士生物信息学研究所以及蛋白质信息资源(PIR). 跨越三个研究所100人涉及不同的任务,如数据库策展,软件开发和支持。

EMB-EBI和SIB一起用于产生瑞士PROT和TrimBL,而PIR产生了蛋白质序列数据库(PIP-PSD)。这两个数据集共存于不同的蛋白质序列覆盖和注释优先级。TrimBL(翻译EMBL核苷酸序列数据库)最初创建是因为序列数据的生成速度超过瑞士PROT的跟上能力。同时,PIR维护了PIP-PSD和相关的数据库,包括IPROBASE,蛋白质序列数据库和对照家庭。在2002,三所研究所决定汇集他们的资源和专业知识,并成立UnPROT联盟。

UnPROT财团由亚历克斯蝙蝠侠(PI)胡家惠艾伦桥支持骨干员工接收来自独立的有价值的输入科学咨询委员会.

资金

UnPROT得到了支持国家眼科学会(NEI)国家人类基因组研究所(NHGRI)国家心肺血液研究所国家老龄研究所国家变态反应与传染病研究所国家糖尿病、消化和肾脏疾病研究所国立普通医学研究所国家精神卫生研究所国家癌症研究所(NCI)美国国立卫生研究院根据授权U24HG07822。EBL-EBI参与UniProt的额外支持来自欧洲分子生物学实验室核心基金英国心脏基金会(BHF)(RG/ 13/5/30112)英国帕金森病(PDUK)GO G1307阿尔茨海默病研究英国(ARUK)授予ARUK-NAS2017A-1,NIH GO赠款U41HG0227 3和开放目标. 瑞士联合政府还通过瑞士联邦政府支持SIB的活动。教育、研究和创新国家秘书处. PIR的UnPROT活动也得到NIH赠款R01GM08064、G08LM010720和P20GM1034 46的支持,以及国家科学基金会(NSF)授予DBI-1062520。

过去资金

UniProt已经得到NIH授权U01HG02212(2002—2010)和U41HG00 6104(2010-2014)的支持。

UNPROT活动在EBLB-EBI中受益于FP7吊索项目(2009—2012年,合同编号226073)和英国心脏基金会补助金(SP / 07/007/23671)。

联合国工会的活动在SIB中受益于通过FP6费利克斯项目(2006年至2009年,合同编号021902)的EC支持,以及FP7项目吊索(2009年至2012年,合同编号226073),庚芬(2009—2013年,合同编号200754),以及微粒体(2009年至2013年,合同号2228 86-2)。

PIR的UNIPRT活动得益于NIH授予HHSN2662004061C(2004-2009)、R01GM08066(2007-2011)、R01GM08066-04S2(2009-2012)、R01GM08066-07S1(2012),以及P20RR01642-09S2(2009-2011),NSF授予DBI-0138188(2002-2005)和IIS-043073(2004-2007)和UNIDEL基金奖(2010-2012)。

进一步信息

联系UNIPRT联盟成员


欧洲生物信息学研究所(EBL-EBI)
威信信托基因组大学
剑桥希克斯顿CB10 1SD
英国
电话:(+ 44 1223)494 444
传真:(+ 44 1223)494 468

瑞士生物信息学研究所
医学中心
1,rue Michel Servet
1211日内瓦4
瑞士
电话:(+ 41 22)379 379 50
传真:(+ 41 22)379 58 58

蛋白质信息资源(PIR)
乔治城大学医学中心
怀特海文街3300号
组曲1200
华盛顿特区20007
美利坚合众国
电话:(+ 1 202)687 1039
传真:(+ 1 202)687 0057

UnPROT是灵丹妙药的核心数据资源
主要资金国立卫生研究院

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