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TD ID=“爆破门限”>期望值(E)阈值是随机数据库中期望匹配数的统计度量。E值越低,匹配的可能性越大。0.1和10之间的E-值通常是可疑的,而超过10的不太可能具有生物学意义。在所有情况下,这些匹配需要手动验证。如果你有一个很短的查询序列,或者很短的区域中的相似性,或者如果你的序列有一个低复杂度的区域,并且你使用“过滤器”选项</Td><P>,一个HRFF=/帮助/序列搜索'目标= 'TopTo' >更多……< /A> </P>,你可能需要增加E阈值。E阈I

<Td ID=“爆破矩阵”>矩阵为对齐中的每个位置分配一个概率得分。BLUSOM矩阵为每个对齐中的位置分配一个概率得分,它是基于在相关蛋白质内的一致性块中已知的替换发生的频率。BLUSOM62是检测弱蛋白质相似性的最好的矩阵之一。如果设置了“Auto'”,则根据查询序列长度选择矩阵。< /Td> < P> < HRFF=/帮助/序列搜索]目标='TopTo' >更多…</A></P>矩阵I

<Td ID=“Balman滤波器”>低复杂度区域>(例如,在<HRFF=http://www. UNPROT.Org/UnPROT/Q0351)> Q0351 </A>,或膜蛋白中的疏水区)中的半胱氨酸趋向于与数据库中的序列产生虚假的、不显著的匹配,该序列具有相同的低复杂度区域,但与生物学无关。如果选择了“过滤低复杂度区域”,则查询序列将运行在程序{ SEG上,低复杂度区域中的所有氨基酸都将被X替换。过滤I

< TD-ID=“爆破缺口”>这将允许在序列中引入间隙,当比较完成时。</Td> <P> < HRFF=/帮助/序列搜索'目标= 'TopTo' >更多…</A></P>有缺口的I

<tdID=“BultNUMAL”>限制返回对齐的数量。</Td> <P> < HRFF=/帮助/序列搜索'目标= 'TopTo' >更多…</A>/P>击打I

序列特征

进入与地位Q9F0J6〔82—85〕
描述
特征键
特征标识符
10 20 30 30 40 50
MQATKIDIDGF-HLVGAIDWNS
60 70 80 80 90 100
VKEYKKGEL乳酸脱氢酶加尔帕利亚奇贝基
110 120 130 130 140 150
FTSLGQQAM-ESHFHKDWP VQVVKHGETL SLGKRTVTFY ETRMLHWPDS
160 170 180 180 190 200
IVASEFFSDQ IPvHTLRAM-RayyIVNP
210 220 230 230 240 250
YAPQTLKIGTLVGAGVAPIVICDPDHGVIF RGADQCTAVY QKYVEVEAQQK
260 270 280 280 290 300
PTNKVVIFYD
310 320 330 330 340 350
ISDAGAVIVG SPTHNNGIP协议
360 370 380 380 390 400
GKMFDFDPATP VKVKNVPTHA DYEQLKTMAQ TIALALKAL

AA
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主要资金国立卫生研究院

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