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<td id=“blast threshold”>期望值(E)阈值是随机数据库中预期匹配数的统计度量。 E值越低,匹配越有可能显著。E值在0.1到10之间通常是可疑的, 和超过10不太可能有生物学意义。在所有情况下,这些匹配都需要手动验证。如果您的查询序列非常短,以检测非常弱的相似性,或短区域中的相似性,或者如果序列的复杂度较低,并且您使用“筛选”选项,则可能需要增加E阈值</a></p>E-阈值

<td id=“blast matrix”>矩阵为对齐中的每个位置分配概率分数。BLOSUM矩阵根据已知在相关蛋白质中的一致性块中发生取代的频率,为每一个位置分配一个概率分数 。BLOSUM62是检测弱蛋白相似性的可用基质中最好的一种。如果设置了“Auto”,将根据查询序列长度选择矩阵。</td><p><a href='/help/sequence searches'target=''u top'>更多</a></p>矩阵

<td id=“blast-filter”>低复杂度区域(例如<a href=“http://www.uniprot.org/uniprot/Q03751”>Q03751中的半胱氨酸,或膜蛋白中的疏水区)倾向于产生与数据库中具有相同低复杂度区域的序列虚假的、无关紧要的匹配,但在生物学上是不相关的。如果 选择了“过滤低复杂度区域”,则查询序列将在程序 段中运行,低复杂度区域中的所有氨基酸将被 替换为 过滤低复杂度区域</a></p>过滤

在序列中引入更多的搜索</a></p>空隙

击打

序列特征

入职及职位Q9F0J6型[69-71]
说明
功能键
特征标识符
10 20 30 40 50
MQATKIIDGF HLVGAIDWNS RDFHGYTLSP MGTTYNAYLV EDEKTTLFDT
60 70 80 90 100
VKAEYKGELL CGIASVID公司PK键 K伊迪尔维克尔尔尔达加尔帕
110 120 130 140 150
Ftslgqkam ESHFHYKDWP vqvkhgetl slgkrtvfy ETRMLHWPDS
160 170 180 190 200
MVSWFADEKV LISNDIFQN IAASERFSDQ IPVHTLEAM REYYANIVNP
210 220 230 240 250
亚普特尔凯伊TLVGAGVAPE FICPDHGVIF RGADQCTFAV QKYVEYAEQK
260 270 280 290 300
经验证的SMWHSTEKMA RVLAESFRDE GCTVKLMWCK ACHHSQIMSE
310 320 330 340 350
ISDAGAVIVG SPTHNNGILP YVAGTLQYIK GLRPQNKIGG AFGSFGWSGE
360 370 380 390 400
STKVLAEWLT GMGFDMPATP VKVKNVPTHA染料QLKTMAQ TIARAKL

AA
Prot核心数据是Unielxir
基金签署人:国立卫生研究院

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