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TD ID=“爆破门限”>期望值(E)阈值是随机数据库中期望匹配数的统计度量。E值越低,匹配的可能性越大。0.1和10之间的E-值通常是可疑的,而超过10的不太可能具有生物学意义。在所有情况下,这些匹配需要手动验证。如果你有一个很短的查询序列,或者很短的区域中的相似性,或者如果你的序列有一个低复杂度的区域,并且你使用“过滤器”选项</Td><P>,一个HRFF=/帮助/序列搜索'目标= 'TopTo' >更多……< /A> </P>,你可能需要增加E阈值。E阈I

<Td ID=“爆破矩阵”>矩阵为对齐中的每个位置分配一个概率得分。BLUSOM矩阵为每个对齐中的位置分配一个概率得分,它是基于在相关蛋白质内的一致性块中已知的替换发生的频率。BLUSOM62是检测弱蛋白质相似性的最好的矩阵之一。如果设置了“Auto'”,则根据查询序列长度选择矩阵。< /Td> < P> < HRFF=/帮助/序列搜索]目标='TopTo' >更多…</A></P>矩阵I

<Td ID=“Balman滤波器”>低复杂度区域>(例如,在<HRFF=http://www. UNPROT.Org/UnPROT/Q0351)> Q0351 </A>,或膜蛋白中的疏水区)中的半胱氨酸趋向于与数据库中的序列产生虚假的、不显著的匹配,该序列具有相同的低复杂度区域,但与生物学无关。如果选择了“过滤低复杂度区域”,则查询序列将运行在程序{ SEG上,低复杂度区域中的所有氨基酸都将被X替换。过滤I

< TD-ID=“爆破缺口”>这将允许在序列中引入间隙,当比较完成时。</Td> <P> < HRFF=/帮助/序列搜索'目标= 'TopTo' >更多…</A></P>有缺口的I

<tdID=“BultNUMAL”>限制返回对齐的数量。</Td> <P> < HRFF=/帮助/序列搜索'目标= 'TopTo' >更多…</A>/P>击打I

序列特征

进入与地位Q9F0J6〔338—348〕
描述
特征键
特征标识符
10 20 30 30 40 50
MQATKIDIDGF-HLVGAIDWNS
60 70 80 80 90 100
VKEYKKGEL
110 120 130 130 140 150
FTSLGQQAM-ESHFHKDWP VQVVKHGETL SLGKRTVTFY ETRMLHWPDS
160 170 180 180 190 200
IVASEFFSDQ IPvHTLRAM-RayyIVNP
210 220 230 230 240 250
YAPQTLKIGTLVGAGVAPIVICDPDHGVIF RGADQCTAVY QKYVEVEAQQK
260 270 280 280 290 300
PTNKVVIFYD
310 320 330 330 340 350
ISDAGAVIVG SPTNNGILYYVATLQQYK-GLRPQNKIgG AFGSFGWS通用电器
360 370 380 380 390 400
GKMFDFDPATP VKVKNVPTHA DYEQLKTMAQ TIALALKAL

AA
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主要资金国立卫生研究院

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