TD ID=“爆破门限”>期望值（E）阈值是随机数据库中期望匹配数的统计度量。E值越低，匹配的可能性越大。0.1和10之间的E-值通常是可疑的，而超过10的不太可能具有生物学意义。在所有情况下，这些匹配需要手动验证。如果你有一个很短的查询序列，或者很短的区域中的相似性，或者如果你的序列有一个低复杂度的区域，并且你使用“过滤器”选项</Td><P>，一个HRFF＝/帮助/序列搜索'目标= 'TopTo' >更多……< /A> </P>，你可能需要增加E阈值。E阈^I

零点零零零一零点零零一零点零一零点一一十一百一千

<Td ID=“爆破矩阵”>矩阵为对齐中的每个位置分配一个概率得分。BLUSOM矩阵为每个对齐中的位置分配一个概率得分，它是基于在相关蛋白质内的一致性块中已知的替换发生的频率。BLUSOM62是检测弱蛋白质相似性的最好的矩阵之一。如果设置了“Auto'”，则根据查询序列长度选择矩阵。< /Td> < P> < HRFF＝/帮助/序列搜索]目标＝'TopTo' >更多…</A></P>矩阵^I

汽车BLUOS45BLUSO-62布洛姆-80PAM-70PAM-30

<Td ID=“Balman滤波器”>低复杂度区域>（例如，在<HRFF＝http://www. UNPROT.Org/UnPROT/Q0351）> Q0351 </A>，或膜蛋白中的疏水区）中的半胱氨酸趋向于与数据库中的序列产生虚假的、不显著的匹配，该序列具有相同的低复杂度区域，但与生物学无关。如果选择了“过滤低复杂度区域”，则查询序列将运行在程序{ SEG上，低复杂度区域中的所有氨基酸都将被X替换。过滤^I

无过滤低复杂度区域仅掩模查找表

< TD-ID=“爆破缺口”>这将允许在序列中引入间隙，当比较完成时。</Td> <P> < HRFF＝/帮助/序列搜索'目标= 'TopTo' >更多…</A></P>有缺口的^I

对不

<tdID=“BultNUMAL”>限制返回对齐的数量。</Td> <P> < HRFF＝/帮助/序列搜索'目标= 'TopTo' >更多…</A>/P>击打^I

五十一百二百五十五百七百五十一千