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TD ID=“爆破门限”>期望值(E)阈值是随机数据库中期望匹配数的统计度量。E值越低,匹配的可能性越大。0.1和10之间的E-值通常是可疑的,而超过10的不太可能具有生物学意义。在所有情况下,这些匹配需要手动验证。如果你有一个很短的查询序列,或者很短的区域中的相似性,或者如果你的序列有一个低复杂度的区域,并且你使用“过滤器”选项</Td><P>,一个HRFF=/帮助/序列搜索'目标= 'TopTo' >更多……< /A> </P>,你可能需要增加E阈值。E阈

<Td ID=“爆破矩阵”>矩阵为对齐中的每个位置分配一个概率得分。BLUSOM矩阵为每个对齐中的位置分配一个概率得分,它是基于在相关蛋白质内的一致性块中已知的替换发生的频率。BLUSOM62是检测弱蛋白质相似性的最好的矩阵之一。如果设置了“Auto'”,则根据查询序列长度选择矩阵。< /Td> < P> < HRFF=/帮助/序列搜索]目标='TopTo' >更多…</A></P>矩阵

<Td ID=“Balman滤波器”>低复杂度区域>(例如,在<HRFF=http://www. UNPROT.Org/UnPROT/Q0351)> Q0351 </A>,或膜蛋白中的疏水区)中的半胱氨酸趋向于与数据库中的序列产生虚假的、不显著的匹配,该序列具有相同的低复杂度区域,但与生物学无关。如果选择了“过滤低复杂度区域”,则查询序列将运行在程序{ SEG上,低复杂度区域中的所有氨基酸都将被X替换。过滤

< TD-ID=“爆破缺口”>这将允许在序列中引入间隙,当比较完成时。</Td> <P> < HRFF=/帮助/序列搜索'目标= 'TopTo' >更多…</A></P>有缺口的

<tdID=“BultNUMAL”>限制返回对齐的数量。</Td> <P> < HRFF=/帮助/序列搜索'目标= 'TopTo' >更多…</A>/P>击打

序列特征

进入与地位P24475〔504—512〕
描述
特征键螺旋线
特征标识符
10 20 30 30 40 50
MEDHFGVQQQ IQPNVISVRL FKRKVGGLGFLVKEVSKPP VISDLLIGG
60 70 80 80 90 100
乙酰胆碱酯酶
110 120 130 130 140 150
EGFTTHLITT FTGDGTPKTI RVTQPLGPPT KAVDLSHQPP AGKEQPLAVD
160 170 180 180 190 200
SalpangLay-RPPGQDPAKK ATLVSLQGRG
210 220 230 230 240 250
EnkelkgpAg/EMCKMGQQV-DLDLDGKSKK
260 270 280 280 290 300
PLPLGVENDR VFNDLWGKGN VPVVLNNPES EKEQPPTGSK QSPTKNGSP
310 320 330 330 340 350
KCPRFLKVKN-WHEVEVLTDT LHLKSTLTEG CTTEYICMGSI MHPSQARRP
360 370 380 380 390 400
EDVRTKGQLF
410 420 430 430 440 450
LKDTELIYGA-KHWRASNRC VGRIQQWSLQ VFADDCTTA HGMFNYICNH
460 470 480 480 490 500
VKYATNKNGL RSAIIFTPQR TDGKHDFRVW NQLILYGAY
510 520 530 530 540 550
平底锅VQFTEIC 智商QGWKPKPRG
560 570 580 580 590 600
IrpPKFEFFK-DLGLKWYGLP
610 620 630 630 640 650
RDyCDNSRN-ILIVAKKMN LDMRKTSLW KDQPOLANI AVLISSFQSDK
660 670 680 680 690 700
VTVDHHSAT ESFKHMENE YRCRGCPADVWVIVPPMSG SITPVFHQEM
710 720 730 730 740 750
LNYRLTPSFE YQPDPWNTHV WKGTNGTPTK RRAIGFKKLA EAVKFSAKLM
760 770 780 780 790 800
我想买一辆车
810 820 830 830 840 850
LeHETLVLV TSTFGNGDPP
860 870 880 880 890 900
NSSSSYSDSQ KSSGDGPDLR DNFESGAPLA NVRVSVFGLG SRAYPHFCAF
910 920 930 930 940 950
我想说
960 970 980 980 990 1000
DVVNIEKANSISLNNDRSWK RNKFRTLFVA EAPELTQGLSNVHKKRVSAA
1010 1020 1030 1030 1040 1050
RLLSRQNLQS PKSRSSTIFFV RLHTNGQEL QYQPGDHLGV
1060 1070 1080 1080 1090 1100
AlpReqtVel-LenntAlv iSnWtDelRL pPCTIFQAFK
1110 1120 1130 1130 1140 1150
YLIDITTPTPPLQLQQFASL ATSEKEKQRL LVLSKLQY EEWKWGKPT
1160 1170 1180 1180 1190 1200
IVEVELFEPS公司
1210 1220 1230 1230 1240 1250
ILHHGVCSWL NRQADADELVP CFVRGAPSFFH LPRNPQVPCI
1260 1270 1280 1280 1290 1300
LVGPGTGIAP FRSFWQQRQF DQHKGMNPC PMVLFGCRQ
1310 1320 1330 1330 1340 1350
TyqKNKKGVF
1360 1370 1380 1380 1390 1400
IyvcgdvtMaAdvkaqRi MTQQGLKSAE DAGVFISRMR DDNRYHEDIF
1410 1420 1420
VFSS
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主要基金国立卫生研究院

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