mpiBLAST公司

mpiBLAST:开源并行BLAST。mpiBLAST是NCBI-BLAST的一个免费的、开源的并行实现。mpiBLAST通过数据库分段、查询分段、智能调度和并行I/O有效地利用分布式计算资源,将NCBI-BLAST性能提高了几个数量级,同时扩展到数百个处理器。mpiBLAST还可以跨许多不同的平台和操作系统进行移植。最后,对许多代码库的重新关注和整合使mpiBLAST在生物信息学领域继续具有很高的实用性。


zbMATH中的参考文献(参考文献15条)

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按年份排序(引用)

  1. 博雅,琼;Ellen,Faith:限制电网调度的严格界限(2019年)
  2. 博雅,琼;Favrholdt,Lene M.:一个新的可变尺寸装箱问题(2012)
  3. 施密特,安德鲁G。;达塔,悉达多;门顿,阿什温A。;Sass,Ron:使用全FPGA集群高效扩展I/O绑定流媒体应用的调查(2012)ioport公司
  4. 迪亚斯,大卫;埃斯特班,弗朗西斯科·何塞;赫尔南德斯,皮拉尔;卡巴莱罗,胡安·安东尼奥;多拉多,加布里埃尔;Gálvez,Sergio:多核体系结构的生物信息学成对序列比对算法的并行化和优化(2011)ioport公司
  5. 苏萨,马塞洛S。;梅洛,阿尔巴C.M.A。;boucharche,Azzedine:一个用于生物序列比较的自适应多策略网格服务(2010)
  6. 沃伦,安德鲁S。;阿丘利塔,杰里米S。;冯武春;塞图巴尔,乔·卡洛斯:原核基因组注释中的缺失基因(2010)ioport公司
  7. 王超;张哲;马晓松;瓦兹库代,苏达山S。;Mueller,Frank:使用时间复制提高超级计算机作业输入数据的可用性(2009)ioport公司
  8. 罗格朗,阿诺;苏,艾伦;Vivien,Frédéric:在调度可分割请求流时最小化拉伸(2008)
  9. 丁朝晖;魏晓辉;罗、元;妈妈,爸爸;阿兹伯格,彼得W。;Li,Wilfred W.:metascheduler CSF4中用于生命科学应用的定制插件模块(2007)
  10. 辛诺特,理查德;阿贾伊,奥卢瓦费米;江吉浦;斯特尔,安东尼;Watt,John:面向用户的安全支持跨学科生命科学研究(2007)ioport公司
  11. 吉特希,P.V。;多纳奇,P。;哈默,T。;凯利,N。;佩罗特,R。;瓦斯尼克。;约翰斯顿,J。;麦考利,M。;汤斯利,M。;McKee,S.:GeneGrid:架构、实现和应用(2006)ioport公司
  12. 吉特希,P.V。;多纳奇,P。;哈默,T。;凯利,N。;佩罗特,R。;瓦斯尼克。;约翰斯顿,J。;麦考利,M。;汤斯利,M。;McKee,S.:GeneGrid:架构、实现和应用(2006)
  13. 谭光明;徐林;不,董波;冯盛忠;孙宁辉:改进megablast算法的DNA序列比对性能(2006)ioport公司
  14. 朱涛;周建峰;安,玉明;周金华;李鸿宇;徐刚;Ma,Ding:基于岩簇的EST分析管道的构建和特征(2006)
  15. Krishnan,Arun:网格上生命科学应用的调查(2004)


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