mpiBLAST公司

mpiBLAST:开源并行BLAST。mpiBLAST是NCBI-BLAST的一个免费的、开源的并行实现。mpiBLAST通过数据库分段、查询分段、智能调度和并行I/O有效地利用分布式计算资源,将NCBI-BLAST性能提高了几个数量级,同时扩展到数百个处理器。mpiBLAST还可以跨许多不同的平台和操作系统进行移植。最后,对许多代码库的重新关注和整合使mpiBLAST在生物信息学领域继续具有很高的实用性。


zbMATH参考文献(15篇文章引用)

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按年份排序(引用)

  1. Joan Boyar;Ellen,Faith:受限网格调度的严格界限(2019)
  2. Boyar,Joan;Favrholdt,Lene M.:一个新的可变尺寸包装问题(2012)
  3. Schmidt,Andrew G.;Datta,Siddhartha;Mendon,Ashwin A.;Sass,Ron:使用全FPGA集群高效扩展I/O绑定流媒体应用的调查(2012年)ioport公司
  4. David Díaz;Esteban,Francisco José;Hernández,Pilar;Caballero,Juan Antonio;Dorado,Gabriel;Gálvez,Sergio:多核体系结构的生物信息学成对序列比对算法的并行化和优化(2011)ioport公司
  5. Sousa,Marcelo S.;Melo,Alba C.M.A.;boucharche,Azzedine:用于生物序列比较的自适应多策略网格服务(2010)
  6. Warren,Andrew S.;Archuleta,Jeremy S.;Feng,Wu Chun;Setubal,João Carlos:原核基因组注释中的缺失基因(2010)ioport公司
  7. Wang,Chao;Zhang,Zhe;Ma,Xiaosong;Vazhkudai,Sudharshan S.;Mueller,Frank:使用时间复制提高超级计算机作业输入数据的可用性(2009)ioport公司
  8. 罗格朗,阿诺;苏,艾伦;费雯,弗雷德里克:在调度可分割请求流时最小化延伸(2008)
  9. 丁朝辉;魏晓辉;罗,袁;马,达;阿兹伯格,彼得W.;李,威尔弗雷德W.:面向生命科学应用的元调度器CSF4中的定制插件模块(2007)
  10. Richard Sinnott;Ajayi,Oluwafemi;Jiang,Jipu;Stell,Anthony;Watt,John:面向用户的安全支持跨学科的跨网格生命科学研究(2007)ioport公司
  11. Jithesh,P.V.;Donachy,P.;Harmer,T.;Kelly,N.;Perrott,R.;Wasnik,S.;Johnston,J.;McCurley,M.;Townsley,M.;McKee,S.:GeneGrid:架构、实现和应用(2006)ioport公司
  12. Jithesh,P.V.;Donachy,P.;Harmer,T.;Kelly,N.;Perrott,R.;Wasnik,S.;Johnston,J.;McCurley,M.;Townsley,M.;McKee,S.:GeneGrid:架构、实现和应用(2006)
  13. 谭广明;许,林;步东波;冯胜忠;孙宁辉:改进megablast算法的DNA序列比对性能(2006)ioport公司
  14. 徐建华,徐建华;徐建华,刘建华;徐建华,刘建华;刘建华,刘建华;刘建华,刘建华;刘建华,刘建华;刘建华,刘建华;刘建华,刘建华;刘建华,刘建华;刘建华,刘建华;刘建华,刘建华;刘建华,刘建华;刘建
  15. Krishnan,Arun:网格上生命科学应用的调查(2004)


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