M.DynaMix公司 swMATH ID: 9596 软件作者： Alexander P.Lyubartsev，Aatto Laaksonen公司 描述： M.DynaMix–适用于任意分子混合物的可扩展便携式并行MD模拟软件包。提出了一种通用、可扩展的并行分子动力学软件包，用于模拟柔性或刚性分子的任意混合物。它允许使用大多数类型的传统分子-机械力场，并包含各种分子间和分子内相互作用的辅助项，包括简谐键拉伸。它可以处理各向同性或有序系统。除了NVE集成外，还可以分别使用Nosé–Hoover恒温器和气压调节器在NVT或NPT集成中进行模拟。如果需要，可以通过保持各向异性压力来生成NPT集合。模拟单元可以是立方、矩形、六角形或截断的八面体，具有相应的周期性边界条件和最小图像。在所有情况下，优化的Ewald方法都可以用于处理库仑相互作用。包括双时间步长或约束动力学方案。可以在模拟单元上施加外部电场。整个程序是高度模块化的，用标准Fortran 77编写。它可以编译为在并行计算机和顺序计算机上高效运行。所研究系统的固有复杂性不会影响程序的可扩展性。伸缩性与系统的大小和处理器的数量有关。该程序的可移植性很好，它可以在几个常见的单处理器和多处理器平台上正常运行，包括标量和矢量体系结构。 主页： http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S001046599005299 相关软件： 供应商管理部 引用于： 3文件 5位作者引用 2 塔季扬娜·库兹涅佐娃 2 比约恩·科瓦姆 1 Aatto Laaksonen公司 1 亚历山大·P·吕巴特塞夫（Alexander P.Lyubartsev）。 1 丹尼尔·厄普斯塔德 3篇连载文章中引用 1 计算机物理通信 1 数学和计算机建模 1 数学化学杂志 在4个字段中引用 1 流体力学（76-XX） 1 量子理论（81-XX） 1 统计力学，物质结构（82-XX） 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文