摇摆舞

联合和个体变异解释(JIVE)用于综合分析多种数据类型。现在有几个领域的研究需要对数据集进行分析,在这些数据集中,有多种高维类型的数据可用于一组共同的对象。特别是,癌症基因组图谱(TCGA)包含了来自多种不同基因组技术的数据,这些数据来自同一个癌症肿瘤样本。本文介绍了联合和个别变异解释(JIVE),这是一种对这类数据集进行综合分析的一般变异分解。分解包括三个项:捕获跨数据类型的联合变化的低秩近似,针对每个数据类型的结构化变化的低秩近似,以及残余噪声。JIVE量化了数据类型之间的联合变化量,降低了数据的维数,为节理和单个结构的可视化探索提供了新的方向。该方法是主成分分析的一个推广,与经典相关分析和偏最小二乘法等常用的两个分块方法相比,具有明显的优势。对胶质母细胞瘤多形性肿瘤样本的基因表达和miRNA数据的JIVE分析揭示了基因miRNA的相关性,并提供了更好的肿瘤类型特征。par数据和软件可在https://genome.unc.edu/jive/。


zbMATH中的参考文献(参考文献12条)

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