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JIVE公司

swMATH ID: 9511
软件作者: 埃里克·F·洛克。;凯瑟琳·霍德利。;Marron,J.S。;诺贝尔,安德鲁B。
描述: 解释的联合和个别变化(JIVE)用于多数据类型的综合分析。现在,多个领域的研究需要对数据集进行分析,在这些数据集中,一组公共对象可以使用多种高维类型的数据。特别是,《癌症基因组图谱》(TCGA)包含了来自多种不同基因组技术的数据,这些数据是关于同一种癌症肿瘤样本的。本文介绍了解释联合变异和个体变异(JIVE),这是一种用于综合分析此类数据集的变异的一般分解。分解由三个项组成:低阶近似捕获跨数据类型的联合变化,低阶近似用于每个数据类型的结构化变化,以及残余噪声。JIVE量化了数据类型之间的关节变化量,降低了数据的维数,并为关节和单个结构的可视化探索提供了新的方向。该方法是主成分分析的一种扩展,与经典相关分析和偏最小二乘等常用的两块方法相比具有明显的优势。对多形性胶质母细胞瘤样本的基因表达和miRNA数据的JIVE分析揭示了基因与miRNA的关联,并提供了更好的肿瘤类型特征。par数据和软件可在https://genome.unc.edu/jive/。
主页: 网址:https://genome.unc.edu/jive/
关键词: 数据集成;多块数据;主成分分析;数据融合
相关软件: 项目管理局;github;Scikit公司;AJIVE公司;蟒蛇;PyTorch公司;Seaborn公司;ElemStatLearn(电子状态学习);马特普洛特利布;数字Py;科学Py;R(右);多群集;多画面;mv学习;UCI-毫升;PRMLT公司;烟火;朱庇特;坦索拉布
引用于: 24出版物
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74位作者引用

6 詹姆斯·斯蒂芬·马龙
凯瑟琳·霍德利。
埃里克·F·洛克。
2 伊恩·卡迈克尔
2 大卫·布莱恩·邓森
2 伊琳娜·盖纳诺娃
2 简·汉尼格
2 艾米·赫林(Amy H.Herring)。
2 Gen李
2 诺贝尔,安德鲁B。
2 风险,Benjamin B。
2 沈海鹏
2 舒,海
2 王妙妍
1 皮埃尔·阿布林
1 安贞佑
1 Makoto Aosima
1 白嘉伟
1 罗素·P·鲍勒。
1 本杰明·卡尔霍恩。
1 亚历山大·张
1 Chung,Hee Cheol先生
1 时装,Heather D。
1 冯,清
1 乔纳森·菲舍尔
1 卡梅隆·弗兰兹
1 约瑟夫·杰拉德
1 安东尼·戈迪孔·巴吉奥尼
1 亚历山大·格兰福德
1 菲利普·格林
1 理查德·郭
1 Tamara B.哈里斯。
1 克雷格·赫什。
1 胡嘉欣
1 黄磊
1 安德拉达·E·伊万内斯库。
1 Jeon、Yongho
1 蒋美蕾
1 郑成玉
1 Kharyuk,P.V.公司。
1 阿尔曼·库尔
1 艾萨克·拉文
1 李昌宇
1 李,西奥多
1 大卫·S·马特森。
1 凯西·毛吉斯·拉布绍
1 马修·莫勒
1 加文·米施勒
1 凯利·莫兰(Kelly R.Moran)。
1 斯图尔特·H·莫斯托夫斯基。
1 内贝尔、玛丽·贝思
1 马克·尼塔默尔
1 林尼亚·奥尔森
1 Oseledets、Ivan Valer’evich
1 Elise F.帕尔泽。
1 公园、云英
1 查尔斯·佩罗。
1 罗南·佩里
1 曲、哲
1 雨果·理查德
1 罗伊,阿尔卡普拉瓦
1 桑德拉·萨福(Sandra E.Safo)。
1 沈丹
1 宋云S。
1 梅丽莎·特洛伊斯特(Melissa A.Troester)。
1 约书亚·T·沃格尔斯坦。
1 克里斯汀·温特。
1 马修·惠勒(Matthew W.Wheeler)。
1 杨丹(Yang,Dan)
1 Kazuyoshi Yata
1 赵宇轩
1 周一辉
1 朱洪图
1 瓦迪姆·齐普尼科夫。

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