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金西姆

swMATH ID: 9090
软件作者： Gonzales，A.G。；Naldi，A。；桑切斯，L。；Thieffry博士。；朝义亚，C
描述： GINsim：用于监管网络定性建模、模拟和分析的软件套件。本文介绍了GINsim，一个专门用于遗传调控网络定性建模、分析和模拟的Java软件套件。形式上，我们的方法依赖于离散的数学和图形理论概念。GINsim包含一个直观的图形编辑器，可以定义和参数化监管图形，以及一个模拟引擎来计算相应的定性动态行为。我们的计算方法通过对果蝇翅膀想象盘背腹侧边界处激活Notch的细胞间调节网络的初步模型分析进行了说明。我们重点研究了五个基因（两个细胞内和细胞间）之间的交叉调控，这五个基因实现了发育中的影像盘的背腹边界。我们的模拟定性地再现了野生型发育途径，以及各种实验扰动的结果，例如功能丧失突变或外源诱导的基因表达。
主页： http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0303264705001693
相关软件： BoolNet公司；PyBoolNet网络；漫长的时期；github；CoLoMoTo公司；z3（零3）；麦考利2；亚当；蟒蛇；NuSMV公司；AlzPathway公司；Potassco公司；清爽；侵蚀；亚特兰蒂斯；MaBoSS公司；单一；GNA公司；多刀；mCRL2型
引用于： 42文件
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被92位作者引用

6 克劳迪娜·朝义亚
6 伊丽莎白·雷米
4 塞缪尔·帕斯特瓦
4 丹尼斯·蒂夫里
三 尼古拉·贝内什
三 卢博什·布里姆
三 马修·麦考利
三 奥雷连·纳尔迪
三 理查德·阿德里安
三 萨夫拉内克，大卫
2 乔治·阿格里斯
2 贝莱德·本哈莫
2 马达丽娜·查夫斯
2 安迪·詹金斯
2 莱因哈德·劳本巴赫（Reinhard C.Laubenbacher）。
2 卢赫·拉富恩特，阿尔贝托
2 佩德罗·蒙泰罗。
2 西尔万·索利曼
2 米尔科·特里巴斯通
2 范甘·特林
2 马克斯·柴科夫斯基
2 安德烈·范丁
2 阿兰·贝利兹·库巴
1 瓦西姆Abou-Jaoudé
1 文森特·艾卡里
1 拉什德·萨马。
1 阿隆娜·本·塔尔
1 Bérenguier，D。
1 吉尔斯·伯诺
1 伯纳德·布罗格里亚托
1 克里斯汀娜·布舒尔
1 阿方索·卡塔
1 菲利波·卡斯蒂格利奥内
1 苏尼尔·乔普拉
1 Jean-Paul彗星
1 彼得·克劳福德-卡尔
1 布里·康明斯
1 奥利维尔·达梅隆
1 罗宾·戴维斯
1 Hidde德容
1 迪迪埃，吉尔
1 阿德里安·福雷
1 马克西姆·福舍特
1 汤姆·盖迪恩
1 艾托·穆古鲁扎·冈萨雷斯
1 罗丝·哈默肖克
1 Hiraishi、Kunihiko
1 井上，胜美
1 川山良彦
1 石佐卡吉
1 马塞尔·考夫曼
1 哈里斯，Z。
1 克里斯，阿里尔
1 科瓦利克，乌卡斯
1 阿莱塔·克拉内菲尔德。
1 史蒂夫·昆
1 Lee，康博克
1 玛丽亚·康塞桑·莱特。
1 林奇，因斯
1 摩根·马根
1 埃米利亚诺·曼奇尼
1 Vasco M.Manquinho。
1 米哈拉·特奥多拉·马塔奇
1 马塔切，瓦伦丁
1 劳拉·梅尼尼
1 京杜克·穆恩
1 马钦·穆查
1 大卫·默鲁加拉
1 沃伊切赫·纳达拉
1 雅克·尼古拉斯
1 Djomangan Adama，瓦塔拉
1 马钦·皮利普祖克（Marcin L.Pilipczuk）。
1 科拉多·波西耶里
1 雷达，克莱门斯
1 托尼·里贝罗
1 Olivier F.鲁克斯。
1 海克·西伯特
1 安妮·西格尔
1 路易斯·索尔多·维埃拉
1 曼纽尔·索尔吉
1 te Velde，Anje A。
1 洛朗·蒂奇特
1 安东尼奥·托纳姆
1 洛朗·图尼尔
1 Jeroen F.乌尔曼。
1 佩德罗·瓦雷拉。
1 王云娇
1 梅琳·韦里
1 巴特克·威尔钦斯基
1 埃斯特·沃尔夫
1 彼得·维戈奇·维戈奇
1 诺拉·扬
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16篇连载文章中引用

10 理论生物学杂志
6 数学生物学通报
4 理论计算机科学
1 离散应用数学
1 数学生物科学
1 物理D
1 机器学习
1 欧洲运筹学杂志
1 差分方程与应用杂志
1 混乱
1 自然计算
1 SIAM应用动力系统杂志
1 离散算法杂志
1 计算机科学中的逻辑方法
1 应用数学与信息科学
1 自然现象的数学建模
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在15个字段中引用

33 生物学和其他自然科学（92-XX）
11 信息与通信理论、电路（94-XX）
8 计算机科学（68至XX）
5 组合数学（05-XX）
4 数学逻辑和基础（03-XX）
三 动力系统和遍历理论（37至XX）
三 系统论；控制（93至XX）
2 线性代数和多线性代数；矩阵理论（15-XX）
2 运筹学、数学规划（90-XX）
1 阶、格、有序代数结构（06-XX）
1 代数几何（14-XX）
1 拓扑群、李群（22日至XX日）
1 常微分方程（34-XX）
1 差分方程和函数方程（39至XX）
1 统计学（62-XX）

按年份列出的引文