佩德切克

基因型不相容性分析:基因型不相容性分析。在进行连锁分析之前,必须消除系谱数据中所有孟德尔不一致性。通常,通过目视检查来识别错误的基因型是非常困难和耗时的。事实上,有时直到运行联动分析软件的阶段,错误才被识别出来。因此,要找到错误的基因型,并交叉参考可能已被重新编码和重新编号的谱系和标记数据,这不仅是乏味的,而且在非常大的谱系的情况下,也是相当艰巨的。我们在一个新的计算机程序PedCheck中实现了四种错误检查算法,它将帮助研究人员识别家系数据中的所有孟德尔不一致性,并为他们提供有用和详细的诊断信息,以帮助解决错误。我们的程序使用了许多在VITESSE中实现的算法,能够快速高效地处理大数据集,接受各种输入格式,并提供各种与系谱错误的细微之处相匹配的错误检查算法。从简单的基于遗传位点的个体和子代的相容性检验中,可以对个体进行排序。我们使用各种实际数据集来说明我们的程序的功能和有效性。

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zbMATH参考文献(参考 4篇文章 参考)

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  1. Nuel,Gregory;Lefebvre,Alexandra;Bouaziz,Olivier:在存在竞争性风险的情况下,根据遗传病家族史计算个体风险(2017年)
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