香皂 swMATH ID: 8915 软件作者： 李瑞强；李英瑞；卡斯滕·克里斯蒂安森（Karsten Kristiansen）；王军 描述： SOAP：短寡核苷酸比对程序。我们开发了一个程序SOAP，用于将短寡核苷酸有效地对齐到参考序列上。该程序旨在使用新一代Illumina-Selexa测序技术处理并行测序产生的大量短读。SOAP与许多应用程序兼容，包括单读或对端重测序、小RNA发现和mRNA标签序列映射。SOAP是一个命令驱动的程序，支持多线程并行计算，并具有用于多个查询集的批处理模块。 主页： http://soap.genomics.org.cn/ 相关软件： BWA公司;Samtools公司;布拉特;R（右）;SSAHA公司;图案猎人;虾;STAR公司;蝴蝶结2;缩放;顶帽;爆炸;PSI-爆炸;BED工具;肌肉;DIALIGN公司;MAFFT公司;天鹅绒;关贸总公司;HT序列 引用于： 28文件 标准条款 1出版物描述软件 年份 SOAP2：一种改进的超快工具，用于短阅读对齐李瑞强；于，常；李英瑞；林德华；姚兆明；克里斯蒂安森，卡斯滕；王军 2009 全部的 前5名90位作者引用 三 科斯塔斯·S·伊利奥普洛斯。 三 Pissis，Solon P。 2 卡尔·巴顿 2 杰奎琳·戴金。 2 西蒙·高格 2 卡卡尼恩，朱哈 2 维利·梅基宁 2 劳伦特·穆查德 2 夏尔马五世（Sharma V.Thankachan）。 2 Välimäki，尼科 1 柴塔尼亚·阿鲁鲁 1 斯里尼瓦斯·阿鲁鲁 1 瓦西里斯·阿提索斯 1 卡米尔·斯蒂芬·奥托·阿托里尼 1 杰森·本特利（Jason W.Bentley）。 1 保拉博尼佐尼 1 克里斯蒂娜·鲍彻 1 卡鲁戈语、奥利维埃罗语 1 陈阳军 1 斯里拉姆·乔卡林加姆（Sriram P.Chockalingam）。 1 安东尼·考克斯。 1 高塔姆·达斯 1 朱拉特·道格莱特 1 肖恩·戴维斯。 1 科恩·德·里德 1 吉安卢卡·德拉·维多瓦 1 弗兰克·艾森哈伯 1 托马斯·弗洛里 1 崔维斯·盖吉 1 吉安卡洛·拉斐尔 1 丹尼尔·吉布尼 1 玛尔塔·哥尔达 1 理查德·格鲁 1 扬尼克·盖斯奈特 1 托比亚斯·雅科比 1 Ji，袁 1 卡胡、卡勒 1 乔纳森·基思（Jonathan M.Keith）。 1 多米尼克·坎帕 1 亚历克赛省科齐法科斯 1 德里克·库里（Derrick G.Kourie）。 1 曼纽尔·克罗伊斯 1 格雷戈里·库切洛夫 1 阿兰·库内尔 1 苏珊娜·拉德拉 1 本·兰米德 1 蒂埃里·勒克罗克 1 李，收件箱 1 阿诺德·列斐伏尔 1 马丁·莱昂纳德 1 梁，韩 1 梁寿丹 1 林，吉米 1 刘永超 1 乔瓦尼·曼齐尼 1 Mathé，埃维 1 塔赫尔门 1 穆索姆布卡，Themba K。 1 不，洛朗 1 克利夫·朱·诺里斯。 1 艾斯林·奥德里斯科尔 1 帕帕彼得鲁，帕纳吉奥蒂斯 1 公园，坤秀 1 马提亚斯·佩特里 1 尤里·皮罗拉 1 阿尔贝托，Policriti 1 马尔科·普雷维塔利 1 埃利塞·普里厄尔·加斯顿 1 西蒙·普格利西。 1 瑞兹、拉斐拉 1 乔瓦娜·罗森 1 大卫·罗塞尔 1 戴维·斯卡特罗 1 贝蒂尔·施密特 1 舒尔兹·特里格拉夫（Ole B.Schulz-Trieglaff）。 1 沈，卡罗尔 1 沈，托尼 1 奥尔·肖姆罗尼 1 罗伊·D·斯莱特。 1 亚历山大·斯特凡 1 施托克，杏仁 1 亚历山德鲁·伊昂·托梅斯库 1 Tsui，Kam-Wah村 1 菲利波·乌特罗 1 弗朗西斯科·维齐 1 亚历山大·沃尔夫 1 吴宇佳 1 徐彦勋 1 元，元 1 张琼 全部的 前5名12篇连载文章中引用 5 理论计算机科学 三 分子生物学方法 2 离散算法杂志 1 生物计量学 1 计算机与系统科学杂志 1 算法 1 信息与计算 1 数据挖掘与知识发现 1 计算机科学中的数学 1 应用统计学年鉴 1 计算机科学评论 1 ISRN生物数学 在5个字段中引用 23 生物学和其他自然科学（92-XX） 17 计算机科学（68至XX） 4 统计学（62-XX） 1 总体主题；集合（00-XX） 1 运筹学、数学规划（90-XX） 按年份列出的引文