副作用

Paramotopy:参数同伦的软件。数值代数几何界早就知道,参数同伦为求解参数化多项式系统提供了一个强有力的工具。Paramotopy是一个新的软件包,致力于高效、并行地处理大量的参数同伦。Paramotopy利用Bertini的用户定义同伦实现,与Boost和其他库一起有效地处理大量参数值和解决方案。它最初是为解决冗余运动学问题而开发的——参见与D.Brake(北卡罗来纳州立大学)、A.Maciejewski(科罗拉多州立大学)和V.Putkaradze(阿尔伯塔大学)的联合研究。这篇演讲将包括对参数同伦的简要介绍,一个关于副作用的简短教程,以及有关生物化学应用程序的详细信息。特别是,一个生化反应网络的平衡数取决于许多参数值的选择。通过D.Brake、J.Gunawardena(哈佛医学院)、B.Gyori(新加坡国立大学)和K-M Nam(Swarthmore College),我们设计了一系列方法来更好地理解此类问题的参数空间的地理位置,并将参数化作为一个关键因素。


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  1. 达维斯库里,多个国家;马修·格里姆,英格兰;达维斯库里,多个国家;马修·格里姆,多个国家;马修·格里姆,多个国家;马修·格里姆,英格兰;马修·格雷姆,多个州;马修·格雷克,多个州;马修·格雷姆,英格兰
  2. Bates,Dan;Brake,Danielle;Niemerg,Matt:参数同伦并行(2018)
  3. Davenport,James H.(编辑);Kauers,Manuel(编辑);Labahn,George(编辑);Urban,Josef(编辑):数学软件——ICMS 2018。第六届国际会议,南本德,美国,2018年7月24-27日。会议记录(2018)
  4. Daniel J.Bates;Newell,Andrew J.;Niemerg,Matthew E.:解耦高度结构化多项式系统(2017)
  5. Bates,Daniel J.;Newell,Andrew J.;Niemerg,Matthew:BertiniLab:用于求解多项式方程组的MATLAB接口(2016年)
  6. Brake,Daniel A.;Bates,Daniel J.;Putkaradze,Vakhtang;Maciejewski,Anthony A.:协作机器人的工作空间多重性和容错性(2016)
  7. Griffin,Zachary A.;Hauenstein,Jonathan D.:多项式方程组的实解和参数延拓(2015)
  8. Daniel J.Bates;Davis,Brent;Eklund,David;Hanson,Eric;Peterson,Chris:用于寻找多项式系统所有孤立解的扰动同伦(2014)
  9. Daniel J.Bates;Niemerg,Matthew:在同伦延拓中使用monodromy避免高精度(2014)
  10. Cicoli,Michele;Klevers,Denis;Krippendorf,Sven;Mayrhofer,Christoph;Quevedo,Fernando;Valandro,Roberto:具有手性物质的全球弦模型的显式de Sitter通量真空(2014)
  11. 何,杨辉;梅塔,达加什;尼默格,马修;拉姆梅尔,马库斯;瓦莱努,亚历山德罗:探索大参数空间中的势能景观(2013)