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塔维纳

swMATH ID: 8764
软件作者: Oinn,T。;亚的斯亚贝巴,M。;费里斯,J。;D.马文。;Senger,M。;格林伍德,M。;卡弗,T。;格洛弗,K。;波科克,M.R。;Wipat,A.公司。;李,P。
描述: Taverna:一种用于合成和制定生物信息学工作流的工具。动机:在生物信息学的电子实验中,需要协调使用计算工具和信息库。越来越多的这些资源以Web服务的形式通过编程访问提供。生物信息学科学家需要在工作流中协调这些Web服务,作为其分析的一部分。结果:Taverna项目为生命科学界开发了一种用于组成和制定生物信息学工作流的工具。该工具包括一个工作台应用程序,该应用程序为工作流的组合提供图形用户界面。这些工作流是用一种称为简单概念统一流语言(Scuff)的新语言编写的,其中工作流中的每一步都表示一个原子任务。使用了两个示例来说明使用工作台应用程序将硅实验表示为Scuff工作流的简单性。可用性:Taverna工作流系统是开源的,可以下载Scuff工作流示例http://taverna.sourceforge.net
主页: http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/20/17/3045.short
相关软件: 佩加索斯;Java CoG工具包;BioMOBY公司;Globus工具包;汪汪叫;特里亚纳;生物导体;;咯咯笑;冷凝器-G;网格流;阿斯卡隆;EMBOS公司;ClustalW公司;UniProt公司;网格实验室;KNIME公司;火花;针织物;IPython公司
引用于: 8文件

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