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地雷

swMATH ID: 8432
软件作者： 梅耶，P.E。；拉菲特，F。；G.邦坦比。
说明： minet：利用相互信息推断大型转录网络的R/生物导体包。结果：本文介绍了R/Bioconductor包minet（1.1.6版），它提供了一组函数来从数据集推断互信息网络。一旦获得微阵列数据集，该软件包将返回一个网络，其中节点表示基因，边缘模型表示基因之间的统计依赖性，边缘的权重量化特定（例如转录）基因与基因交互的统计证据。在软件包minet中提供了四种不同的熵估计量（经验的、Miller Madow、Schurmann Grassberger和shrink）以及四种不同的推理方法，即相关性网络、ARACNE、CLR和MRNET。此外，该软件包还集成了精度评估工具，如F分数、PR曲线和ROC曲线，以便将推断的网络与参考网络进行比较。结论：minet软件包为从微阵列数据推断转录网络提供了一系列工具。它可以从综合R档案网（CRAN）以及Bioconductor网站免费获得。
主页： http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/minet.html
依赖项： R（右）
相关软件： 阿拉伯国家石油公司;R（右）;同步TReN;边缘R;玻璃制品;记录仪;GeneNetWeaver;生物网格;HHpred公司;KEGG公司;纳莫蒂夫;法国皇家医学会;TRANSFAC公司;dslice公司;快速MMD;ggplot2;能量;dHSIC公司;foreach公司;信息提奥
引用于： 7文件
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20位作者引用

1 安德烈·阿德罗德
1 陈博森
1 陈洛南
1 克里斯托弗·恩格斯特罗姆
1 Grzegorczyk，马可·A。
1 德克·胡斯迈尔
1 帕特里克·约翰逊
1 尼古拉·卡萨波夫。
1 乔纳森·基思（Jonathan M.Keith）。
1 李成伟
1 李铁军
1 斯文·内兰德
1 阿德里安·拉弗瑞（Adrian E.Raftery）。
1 石继凡
1 谢尔盖·西尔维斯特罗夫。
1 弗雷德里克·斯沃特林。
1 霍尔格·威沙普特
1 杨嘉怡
1 威廉·查德（William Chad Young）
1 赵、胡安
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7篇连载文章中引用

1 应用概率的方法与计算
1 熵
1 遗传学和分子生物学中的统计应用
1 数学生物科学与工程
1 科学中国。数学
1 分子生物学方法
1 Springer手册
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在6个字段中引用

6 生物学和其他自然科学（92-XX）
2 总体主题；集合（00-XX）
2 信息与通信理论、电路（94-XX）
1 组合数学（05-XX）
1 统计学（62-XX）
1 计算机科学（68至XX）

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