卢米 swMATH ID: 8431 软件作者： Du P、Kibbe WA、Lin SM 描述： lumi：处理Illumina微阵列的管道。Illumina微阵列正在成为一个流行的微阵列平台。Illumina的BeadArray技术使其预处理和质量控制不同于其他微阵列技术。不幸的是，大多数其他分析都没有利用BeadArray系统的独特特性，而只是结合了最初为Affymetrix微阵列设计的预处理方法。lumi是一种生物导体包，专门用于处理Illumina微阵列数据。它包括数据输入、质量控制、方差稳定、归一化和基因注释部分。具体来说，lumi软件包包括一个方差稳定转换（VST）算法，该算法利用了每个Illumina微阵列上可用的技术复制。包中提供了不同的标准化方法选项和多个质量控制图。为了更好地注释Illumina数据，设计了一个独立于供应商的核苷酸通用标识符（nuID）来识别Illumiana微阵列的探针。nuID注释包和lumi处理结果的输出可以很容易地与其他Bioconductor包集成，以构建Illumina数据的统计数据分析管道。 主页： http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/lumi.html 相关软件： beadarray公司;对;beadarray示例数据;beadarray过滤器;Refplus公司;TM4公司;单通道图形用户界面;生物导体;质量（R）;阿菲 引用于： 0个文档