阿菲

用于分析Affymetrix寡核苷酸阵列的R软件包。我们描述了一个可扩展的交互式环境,用于分析和探索Affymetrix寡核苷酸阵列探针级数据。Affymetrix分析套件提供的软件实用程序总结了探针集的强度,并为每个基因提供了一种表达测量。我们开发这个软件包是因为我们可以从研究单个探测器的强度,或者我们称之为探测器级数据中学到很多东西。我们提供了一些例子,证明了对probelevel数据的访问和方法可以改进质量控制评估、标准化和表达式度量。该软件是作为一个附加软件包实现的,方便地命名为affy,可免费获得和广泛使用的统计语言/软件R(Ihaka和绅士,1996年)。这个软件作为R的一个附加组件的开发,使我们能够利用R提供的基本数学和统计功能以及强大的图形功能。我们的包是作为Linux、Unix和microsoftwindows的开源代码分发的。它是根据GNU通用公共许可证发布的。它是生物导体项目的一部分,可以从http://www.bioconductor.org。


zbMATH中的参考文献(参考文献35条)

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