序列生成

Seq-Gen.序列生成器:一个在系统发育树上分子序列进化的蒙特卡罗模拟中的应用。Seq-Gen是一个程序,它将模拟核苷酸或氨基酸序列在系统发育过程中的进化,使用常见的替代过程模型。实现了一系列的分子进化模型,包括一般可逆模型。核苷酸/氨基酸频率和模型的其他参数可以给出,位点特异性的速率异质性也可以通过多种方式合并。可以读入任意数量的树,程序将为每棵树生成任意数量的数据集。因此,可以很容易地创建大量的复制仿真。它被设计成一个通用的模拟器,包含了大多数常用的(并且在计算上可处理的)分子序列进化模型。上面引用的文章包含了算法的细节,并简要讨论了Seq-Gen的用法。


zbMATH参考文献(参考 30篇文章

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按年份排序(引用)
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