Seq-Gen公司 swMATH编号： 8310 软件作者： 安德鲁·兰伯特（Andrew Rambaut）；尼克·C·格拉斯利 描述： 序列生成器：一个应用程序，用于沿着系统发育树的分子序列进化的蒙特卡罗模拟。Seq-Gen是一个程序，它将使用替换过程的通用模型模拟核苷酸或氨基酸序列沿系统发育的进化。实现了一系列分子进化模型，包括通用可逆模型。可以给出模型的核苷酸/氨基酸频率和其他参数，也可以通过多种方式纳入位点特异性速率异质性。可以读入任意数量的树，程序将为每棵树生成任意数量的数据集。因此，可以轻松创建大型复制模拟集。它被设计成一个通用模拟器，包含了大多数常用的（且易于计算的）分子序列进化模型。上面引用的论文包含了算法的详细信息，并简要讨论了Seq-Gen的使用。 主页： https://academic.oup.com/bioinformatics/article/13/3/235/423110 相关软件： fastDNAml（快速DNAml）;菲利普;生物技术研究所;RAxML公司;Bayes先生;快速树;ASTRAL-II标准;野兽;SVD四重奏;阀杆hy;潘戈恩;猿;模型试验;R（右）;记分员;第8轮;TRANSFAC公司;模因;BioProspector公司;GenRGenS公司 引用于： 26文件 全部的 前5名62位作者引用 2 劳拉·索尔特·库巴特科 2 汤姆·M·W·奈。 2 安德鲁·理查兹 2 马克·苏查德（Marc A.Suchard）。 1 费萨尔·阿巴尼赫 1 查布里埃尔·艾伦 1 特拉维斯·本尼迪克特 1 帕特里克·J·比格斯。 1 埃里克·W·布鲁姆奎斯特。 1 弗莱德里克·博朗格 1 亚历山德拉·卡博尼 1 Cox，Murray P。 1 皮埃尔·达鲁 1 史蒂文·迪克斯（Steven G.Deeks）。 1 迈克尔·德乔治奥 1 马蒂亚斯·德梅尔 1 理查德·德斯珀 1 琳达·迪布 1 彼得·德沃思 1 艾萨克·埃利亚斯 1 莱恩·利奥·埃尔沃思（Ryan A.Leo Elworth） 1 Emmert Streib，弗兰克 1 保罗·费恩黑德 1 French、Nigel P。 1 安德烈亚斯·福希克 1 弗洛里安·加奇 1 奥利维尔·加斯库尔 1 塔尼娅·格塞尔 1 沃尔特·吉尔克斯。 1 Górecki，Paweł 1 阿兰·盖诺奇 1 苏珊·福尔摩斯。 1 梅里利·休恩（Merrilee A.Hurn）。 1 斯内哈拉塔·胡祖尔巴扎尔 1 都铎·B·伊奥内斯库。 1 拉尔斯·S·杰米因。 1 Jhwueng、Dwueng Chwuan 1 厨房，Christina M.R。 1 Kroll，Jing（京·克罗尔） 1 丹尼尔·库里茨克斯（Daniel R.Kuritzkes）。 1 延斯·拉格伦 1 丹·利维 1 彼得罗·利奥 1 刘、梁 1 Loza-Reyes，E。 1 马斌 1 拉杜·米哈埃斯库 1 弗拉基米尔·米宁。 1 阿格涅斯卡·米科维埃卡 1 卢艾州纳赫勒 1 布莱恩·奥米拉。 1 利奥·Pachter 1 彭成勋 1 伊曼纽尔·帕拉迪斯 1 Chunjae公园 1 波莱隆、盖拉尔丁 1 丹尼斯·普朗格 1 Radie，罗莎尔巴 1 约翰·罗宾逊 1 诺亚·A·罗森博格。 1 辛、雷 1 张凯忠 全部的 前5名17篇连载文章中引用 3 遗传学和分子生物学中的统计应用 2 理论计算机科学 2 理论种群生物学 2 分类杂志 2 计算统计与数据分析 1 数学生物学杂志 1 数学生物学通报 1 统计年鉴 1 应用数学与计算 1 统计科学 1 算法 1 组合优化期刊 1 澳大利亚和新西兰统计杂志 1 韩国数学学会通讯 1 JMMA公司。数学建模与算法杂志 1 理论生物学杂志 1 使用R！ 全部的 前5名在7个字段中引用 20 生物学和其他自然科学（92-XX） 11 统计学（62-XX） 5 数值分析（65-XX） 3 概率论与随机过程（60-XX） 3 计算机科学（68至XX） 2 组合数学（05-XX） 1 信息与通信理论、电路（94-XX） 按年份列出的引文