生物贝叶斯 swMATH ID: 8082 软件作者: 马克·吉洛米;弗拉迪斯拉夫·维舍米尔斯基 描述: BioBayes:系统生物学中贝叶斯推理的软件包。动机:生物化学系统的数学建模涉及多个层次的不确定性。对于动力学参数的值、模型的一般结构以及无法直接观察到的生化物种的行为,通常可能存在一定程度的不确定性。贝叶斯推理方法为这些不确定条件下的建模和预测提供了一致的框架。我们提出了一个软件包,用于将贝叶斯推理方法应用于系统生物学问题。结果:本文描述了一个名为BioBayes的软件包,它为贝叶斯参数估计和证据模型排序提供了一个框架,该框架优于使用常微分方程定义的生物化学系统模型。该包是可扩展的,允许开发人员包含其他模块。没有提供此功能的其他此类软件包 主页: http://www.dcs.gla.ac.uk/BioBayes/ 相关软件: PRMLT公司;去梯度推断;贝叶斯DA;ABC-SysBio公司;R(右);PMTK公司;日晷;日;生物-PEPA;车身控制模块;科学Py;SYSBIONS公司;斯坦;达科塔;多重嵌套;波特车轮;SOSlib公司;阿拉伯国家石油公司;玻璃制品;乐团-SINDy 引用于: 21文件 全部的 前5名被46位作者引用 5 德克·胡斯迈尔 三 马克·格雷戈奇克(Marco A.Grzegorczyk)。 2 安德烈·阿德霍尔德 2 Mark A.Girolma。 2 德斯蒙德·海姆。 2 本·麦克唐纳 2 牛、穆 2 西蒙·罗杰斯(Simon A.Rogers)。 1 乔治·阿兰帕齐斯 1 安德烈亚·阿诺德 1 大卫·M·博茨。 1 本·卡尔德黑德 1 爱德华·坎皮略 1 罗南·戴利 1 斯林纳丹达斯马哈帕特拉 1 瓦尼娅·杜基克 1 Economides,雅典娜·E。 1 毛里齐奥·菲利波内 1 安娜·甘宾 1 高欢 1 桑米特拉·戈什 1 彼得·希伯斯(Peter A.J.Hilbers)。 1 Huynh Thu,维安 1 Intep,Somkid公司 1 拉尔斯·卡德拉利 1 彼得·卡纳科夫 1 柯玉琴 1 Petros D.库穆塔科斯。 1 李英毅 1 李志宝 1 阿诺蒂达·麦兹沃伊 1 马哈拉塔·库什克 1 毛雪荣 1 塞尔吉奥·马丁。 1 Johanna Mazur 1 信使Daniel A。 1 Mikołaj,Rybiñski 1 吉多·桑吉内蒂 1 田天海 1 蒂曼,C.A。 1 范瑞尔,N.A.W。 1 范利尔,J。 1 文卡塔拉曼,钱德拉塞卡 1 丹尼尔·瓦尔切利 1 乔·旺迪 1 张海滨 全部的 前5名14篇连载文章中引用 三 统计与计算 2 数学生物学通报 2 计算统计学 1 应用力学与工程中的计算机方法 1 IMA应用数学杂志 1 数学生物科学 1 理论计算机科学 1 机器学习 1 计算统计与数据分析 1 优化方法和软件 1 多尺度建模与仿真 1 统计学在遗传学和分子生物学中的应用 1 理论生物学杂志 1 分子生物学方法 全部的 前5名10个字段中引用 14 统计学(62-XX) 11 生物学和其他自然科学(92-XX) 7 数值分析(65-XX) 4 常微分方程(34-XX) 2 概率论与随机过程(60-XX) 2 运筹学、数学规划(90-XX) 1 偏微分方程(35-XX) 1 计算机科学(68-XX) 1 可变形固体力学(74-XX) 1 系统论;控制(93至XX) 按年份列出的引文