核糖核酸

RNAshapes:一个基于抽象形状的综合RNA分析软件包。我们介绍了一个新的软件包RNAshapes,它集成了基于抽象形状方法的三种RNA分析工具:形状代表分析、形状概率计算和一致形状方法。这个新的包完全是用C重新实现的,在运行时和内存需求方面大大超过了原来的实现。此外,我们添加了一些有用的功能,如具有正确悬挂能量的次优折叠、结构图输出、形状匹配和滑动窗口方法。