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PAUP公司*

swMATH编号： 7834
软件作者： 大卫·斯沃福德
描述： PAUP*：简约下的系统发育分析。PAUP*4.0版是进化树推断软件包的主要升级和新版本，用于Macintosh、Windows、UNIX/VMS或基于DOS的格式。对分子、形态和/或行为数据进行高速计算机分析以推断系统发育关系的影响已远远超出其在进化生物学中的中心作用，现在包括在保护生物学、生态学和法医学研究等领域的应用。PAUP:Phylogeneraty Analysis Using Parsimony以前版本的成功使其成为进化树推断中使用最广泛的软件包。此外，PAUP手册已被证明是一个重要的指南，为早期研究人员提供了系统发育分析的全面介绍，也是该领域专家的重要参考。由于PAUP*4.0中包含了最大似然法和距离法，新版本比以前的版本有了很大的改进。此外，分支定界算法的速度得到了提高，并添加了一些新功能，从一致子树到数据可组合性测试，以及数据结构非随机性的置换测试。这些，再加上许多其他改进，将使PAUP*4.0成为比以前版本的程序和手册更不可或缺的比较生物学分析工具。PAUP*4.0和MacClade 3使用通用数据文件格式（NEXUS），允许在两个程序之间轻松交换数据。
主页： http://paup.csit.fsu.edu/
相关软件： 菲律宾;RAxML公司;Bayes先生;PAML公司;ClustalW公司;fastDNAml（快速DNAml）;SVD四重奏;TNT公司;猿;记录-I-DCM3;野兽;生物技术研究所;R（右）;MAFFT公司;四重奏MaxCut;快速树;格拉帕;PhyML（物理建模语言）;ASTRAL-II标准;Clustal X公司
引用于： 52文件
全部的 前5名

110位作者引用

3 劳拉·索尔特·库巴特科
3 弗雷德里克·麦克莫里斯。
3 广岛那鲁岛
2 迈克尔·查尔斯顿。
2 迪迪埃，吉尔
2 董建荣
2 大卫·费尔南德斯·巴卡
2 朗，科尔比
2 鲍尔斯（Robert C.Powers）。
2 凯瑟琳·圣约翰
2 迈克尔·安东尼·斯蒂尔
2 宋永健
2 Tandy J.沃诺。
1 伊冯·阿贝尔
1 Elizabeth S.奥尔曼。
1 尼娜·阿蒙塔
1 Avner Bar-Hen公司
1 阿德里安·巴布鲁克。
1 巴托斯克·克日什托夫（Krzysztof Bartoszek）
1 塞巴斯蒂安·博克
1 达米安·博格达诺维奇
1 Brinkmeyer，麦芽
1 丹尼尔·布鲁克斯（Daniel R.Brooks）。
1 大卫·布莱恩特
1 蔡志鹏
1 玛尔塔·卡萨内拉·赖斯
1 丹尼尔·卡坦扎罗
1 洛林·克劳福德
1 伊丽莎白·戴维森。
1 理查德·德斯珀
1 马西莫·迪·朱利奥
1 佛罗伦萨多梅纳赫
1 杜志华
1 纳迪亚·埃尔·马布鲁克
1 穆拉德·埃卢米
1 埃斯拉·埃尔登
1 塞利姆·T·埃尔多安。
1 方树成
1 Fernández-Sánchez，耶苏斯
1 Fischer，马雷克
1 埃里克·福特。
1 玛丽娜·加罗特·洛佩斯
1 Pawe Gawrychowskił
1 Krzysztof Giaro先生
1 彼得·吉尔伯特。
1 Sylvain Glémin
1 韦恩·迪安·戈达德
1 马修·戈德温
1 萨索·格里贝尔
1 花泽、Masazumi
1 佐敦·J·海因。
1 海达里、梅萨姆
1 支架，Mark T。
1 克里斯托弗·J·豪。
1 珍妮弗·霍亚尔·卡希尔
1 杰斯珀·詹森
1 J·G·苏姆纳。
1 英格马尔·卡吉
1 萨拉·卡利什尼克·维罗夫舍克
1 贾维德·汗一世。
1 伊瓦·库比卡。
1 格列戈兹·库比奇（Grzegorz M.Kubicki）。
1 曼纽尔·拉丰德
1 Gad M.兰道。
1 马丁·拉斯库克斯
1 李兆贤
1 林，冯
1 林国辉
1 林玉敏
1 韦恩·麦迪森。
1 马亨德拉·马里亚达索
1 弗雷德里克·马特森（Frederick A.IV Matsen）
1 詹姆斯·米内特（James W.Minett）。
1 娜塔莉亚·米舍娃
1 宫川，Kampei
1 莫诺德、安提亚
1 穆勒，E.-Ch。
1 卢艾州纳赫勒
1 帕蒂尼奥·加林多，胡安·安格尔
1 埃内斯托·皮卡迪
1 尼古拉·波塔纳克维奇
1 卡拉·夸利亚列洛
1 约翰·安东尼·罗德斯
1 安德鲁·理查兹
1 唐纳德·林格
1 乌斯曼·W·罗珊。
1 A.J.罗西尼。
1 马努埃拉·罗耶·卡伦齐
1 德里克·鲁思
1 马克·萨巴特·维达莱斯
1 大卫·桑科夫
1 亚历杭德罗·施费尔。
1 威利·施密特
1 Raj Shankarappa
1 道格拉斯·索尔蒂斯。
1 帕梅拉·索尔蒂斯。
1 马修·斯宾塞。
1 克里斯特·斯文森（Krister M.Swenson）。
1 大卫·L·斯沃福德。
1 拉兹洛·塞凯利。
…还有10位作者
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引用于23个系列

8 理论生物学杂志
7 数学生物学通报
6 数学生物科学
4 离散应用数学
2 计算生物学和化学
2 SIAM应用代数和几何杂志
1 信息处理信件
1 数学生物学杂志
1 生物计量学
1 多元分析杂志
1 网络
1 分类杂志
1 统计科学
1 算法
1 信息与计算
1 自动推理杂志
1 应用数学快报
1 欧洲运筹学杂志
1 组合优化期刊
1 国际应用数学与计算机科学杂志
1 机器学习研究杂志（JMLR）
1 离散算法杂志
1 计算生物学
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13个领域引用

47 生物学和其他自然科学（92-XX）
11 计算机科学（68至XX）
9 组合数学（05-XX）
7 运筹学、数学规划（90-XX）
5 统计学（62-XX）
3 概率论与随机过程（60-XX）
3 数值分析（65-XX）
2 总体主题；集合（00-XX）
1 有序，格，有序代数结构（06-XX）
1 代数几何（14-XX）
1 变分法与最优控制；最优化（49至XX）
1 代数拓扑（55-XX）
1 博弈论、经济学、金融和其他社会和行为科学（91-XX）

按年份列出的引文