MEGA4公司 swMATH ID: 7695 软件作者: 田村光一郎;乔尔·达德利;内正太;苏迪尔·库马尔 描述: 我们宣布发布MEGA软件的第四版,该软件扩展了现有设施,用于编辑来自自动测序器的DNA序列数据、挖掘网络数据库、执行自动和手动序列比对、分析序列比对以估计进化距离、推断系统发育树、,并测试进化假说。版本4包括一个独特的工具,用于生成以图例格式编写的标题,以便提供分析中使用的模型和方法的自然语言描述。该设施旨在促进更好地理解分析中使用的基本假设以及产生的结果。另一个新特征是最大复合似然(MCL)方法,用于同时估计所有序列对之间的进化距离,包括和不包括位点之间的速率变化和谱系之间的替代模式异质性。这种MCL方法也可以在不了解系统发育树的情况下用于估计转换/颠换偏倚和核苷酸替代模式。这个新版本是一个具有多线程和多用户支持的本地32位Windows应用程序,也可以在Linux桌面环境(通过Wine兼容层)和基于Intel的Macintosh计算机上的Parallels程序中运行。MEGA的当前版本免费提供http://www.megasoftware.net。 主页: http://www.megasoftware.net/mega4/mega.html 相关软件: MEGA公司;肌肉;群集查找;PAML公司;Bayes先生;PAL2NAL公司;大坝;模型测试;T-咖啡;威卡;低压断路器;记录-I-DCM3;玫瑰色;菲利普;R(右);Omni-优化程序;SPEA2公司;Mbetoolbox;生物 引用于: 6文件 全部的 前5名21位作者引用 1 雅切克·Błażewicz 1 陈静安 1 巴望·K·达尔。 1 彼得·福马诺维奇 1 亚历山德罗·朱利安尼 1 里卡多·格劳 1 黄遵南 1 Shan-Lin洪 1 Pawe Kedziora 1 林浩 1 刘勇 1 巴维尔·马西尼亚克 1 阿库特桑卡S.奈尔。 1 萨里萨·南布迪里 1 尼兰詹·雷迪(B.P.Niranjan Reddy)。 1 G.B.K.S.普拉萨德。 1 钱洁英 1 罗伯西·桑切斯 1 孙宁 1 普尔泽米斯劳·塔伦特 1 王秀英 引用于5个系列 2 理论生物学杂志 1 数学生物科学 1 运筹学年鉴 1 应用统计学杂志 1 计算生物学和化学 在4个字段中引用 6 生物学和其他自然科学(92-XX) 1 场论和多项式(12-XX) 1 统计学(62-XX) 1 数值分析(65-XX) 按年份列出的引文