皮波普 swMATH ID: 746 软件作者: 亚历克斯·兰卡斯特;Nelson,Mark P。;迈耶,迪奥戈;格伦斯·汤姆森;单身,Richard M。 描述: 分析整个群体的多基因座基因型数据的软件有助于估计单倍型频率、偏离Hardy-Weinberg平衡和连锁不平衡模式。这些统计结果对那些对人类基因组变异和疾病易感性以及进化遗传学感兴趣的人都很重要。作为第13届国际组织相容性和免疫遗传学工作组(IHWG)的一部分,我们开发了一个软件框架(PyPop)。该软件包的主要新颖之处在于,它通过大量利用XML文件格式和R统计软件包来查看图形输出,同时保留与现有软件交互操作的能力,从而允许跨大量数据集集成统计信息。然而,它主要用于处理人类人口数据,可以用于任何生物体的基于人口的数据。我们利用第13届IHWG的数据测试了我们的软件,该数据涉及来自至少50个实验室的数据集,每个实验室有多达1000个个体,共有9个MHC基因座(I类和11类),并发现它可以很好地扩展到大量数据集。 主页: http://www.pypop.org/ 相关软件: 图书馆lt;基因流行;蟒蛇;阿尔列金;菲利普;数字Py;SWIG(开关);对 引用于: 1文件 标准条款 1出版物描述软件,包括1出版物以zbMATH为单位 年份 PyPop:人口基因组的软件框架:分析大规模多基因座基因型数据。 Zbl 1256.92001号亚历克斯·兰卡斯特;Mark P.纳尔逊。;迪奥戈·梅耶;格伦斯·汤姆森;单身,Richard M。 2002 5位作者引用 1 亚历克斯·兰卡斯特 1 迪奥戈·梅耶 1 Mark P.纳尔逊。 1 单身,Richard M。 1 Glenys J.汤姆森。 0连载引用 在2个字段中引用 1 统计学(62-XX) 1 生物学和其他自然科学(92-XX) 按年份列出的引文