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MATLAB系统生物学工具箱:系统生物学研究的计算平台。我们为广泛使用的通用数学软件MATLAB提供了一个系统生物学工具箱。工具箱为系统生物学家提供了一个开放和可扩展的环境,在这个环境中,可以探索思想、原型和共享新算法,并为生物和生化系统的分析和仿真构建应用程序。此外,它非常适合教育目的。工具箱通过提供SBML模型的导入和导出接口来支持系统生物学标记语言(SBML)。通过这种方式,工具箱可以很好地连接到其他支持SBML的建模包。模型以内部模型格式表示,可以通过输入常微分方程或更直观地通过输入生化反应方程来描述。工具箱中包含了大量的分析方法,如确定性和随机模拟、参数估计、网络辨识、参数灵敏度分析和分岔分析等。


zbMATH中的参考文献(参考文献17条)

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按年份排序(引用)

  1. 斯大立德赞,埃吉斯;兰德曼,卡特里娜;苏林斯,朱瑞斯;Sahle,Sven:多重优化运行揭示的动力学模型全球随机优化的误解风险(2019年)
  2. 阿尔瓦雷斯·布伊拉·罗切斯,玛丽娅·埃琳娜;马丁内斯加西亚,胡安卡洛斯;Dávila Velderrain,何塞;Domínguez-Hüttinger,Elisa;Martínez-Sánchez,Mariana Esther:医疗系统生物学建模方法。疾病过程出现背后的监管动态(2018年)
  3. Edwin Tye,Tom Finnie,Ian Hall,Steve Leach:PyGOM-简化常微分方程系统建模的Python包(2018)阿尔十四
  4. 拉兰吉拉,西芒;西蒙兹,Mkael;杰奎琳宫;佩恩,斯蒂芬J。;Orlowski,Piotr:视神经脊髓炎细胞肿胀的数学模型(2017)
  5. Justin Feigelman,Stefan Ganscha,Manfred Claassen:matLeap:一种适用于贝叶斯推理的快速自适应Matlab ready tau跳跃实现(2016)阿尔十四
  6. 德兰人,德尔菲;Kłosiewicz,Przemysław;布罗克霍夫,一月;Vanroose,Wim:用Python中的数值连续工具箱求解一般生长素运输模型:PyNCT(2015)
  7. Khoshnaw,Sarbaz H.A.:减少进口活跃出口的动力学模型(2015)
  8. Liu,Weijiu:储存操作的钙进入可以防止膜电位持续峰值,以维持正常的细胞内钙振荡和胰腺(\beta)细胞的正常电位爆裂(2013)
  9. 安达萨里,V。;Chaplain,M.A.J.:癌细胞侵袭过程中细胞基质粘附的细胞内模拟(2012)
  10. 罗德里格斯·费尔南德斯,玛丽亚;班加,朱利奥R。;Doyle,Francis J.III:新的全局敏感性分析方法,说明输入参数分布的关键作用:应用于系统生物学模型(2012)
  11. 波希根,布雷特A。;李,京卜;Pfeifer,Blaine A.:异源聚酮生物合成中表型空间的计算分析——应用于\texttescherichiacoli、\texitbacillussubtilis和\textITsaccharomycescrevisiae(2010)
  12. 普雷迪,凯瑟琳F。;彼得,肖格。;刘思佳;马扎维诺斯,阿纳斯塔西奥斯;牧师,马克·A·J。;Hubbard,Stephen F.:模拟宿主寄生系统中感染的接触传播:病原体的垂直传播可能导致混乱(2010)
  13. 克鲁蒂埃,马修;博格,菲奇拉B。;洛瑞,约翰P。;Wellstead,Peter:使用体内神经化学测量的脑能量代谢综合动态模型(2009)ioport公司
  14. 赖欣;尼科洛夫,斯维托斯拉夫;沃尔肯豪尔,奥拉夫;Vera,Julio:红细胞生成中JAK2-STAT5信号调制效应的多层次模型(2009)
  15. 佩鲁马尔,塔尼尔姆。;吴燕;Gunawan,Rudiyanto:基于格林函数矩阵的蜂窝网络动力学分析(2009)
  16. 阿德林德M.乌尔马彻。;他妈的,简;耶施克,马提亚;约翰,马蒂亚斯;莱伊,斯特凡;莫斯,卡斯滕;Röhl,马蒂亚斯;伊瓦尔德,罗兰:一个建模形式和模拟器是不够的!基于jamesii(2008)的计算生物学展望ioport公司
  17. 施密特,亨宁;Jirstrand,Mats:MATLAB系统生物学工具箱:系统生物学研究的计算平台(2006)ioport公司