GENeVis公司 swMATH ID: 6743 软件作者: Michel A.Westenberg。;van Hijum,Sacha A.F.T。;安德烈·卢尔科(Andrzej T.Lulko)。;奥斯卡·P·柯伊伯。;Jos B.T.M.罗尔丁克。 说明: 基因调控网络与相关基因表达时间序列数据的交互式可视化我们提出了GENeVis,一种在基因调控网络环境中可视化基因表达时间序列数据的应用程序。这是一个调节蛋白网络,调节各自目标基因的表达。网络用图形表示,其中节点表示基因,边缘表示基因与其目标之间的相互作用。GENeVis添加了现有工具中目前缺乏的功能,例如将表达式值和相应的p值(或其他统计数据)映射到单个视觉属性、多时间点可视化以及在一个视图中对多个时间序列进行视觉比较。各种交互机制,如平移、缩放、调节器和目标高亮显示、数据选择和工具提示,都支持数据分析和探索。可以在单独的视图中详细研究子网络,该视图显示网络上下文、表达式数据图和包含原始表达式数据的表。我们提出了一个案例研究,其中内部获得的基因表达时间序列数据由生物专家使用GENeVis进行分析。该案例研究表明,该应用填补了目前在逐基因基础上对时间序列实验进行的生物学解释与对受调节蛋白调节的全球基因类别的分析之间的空白。 主页: 网址:http://www.win.tue.nl/~mwestenb/genevis/ 关键词: 可视化基因表达时间序列数据 相关软件: 线路;DeepWalk公司;节点2vec;graph2vec(图形2vec);地形布局;前缀;全球价值链 引用于: 2文件 标准条款 1出版物描述软件,包括1出版物以zbMATH为单位 年份 基因调控网络与相关基因表达时间序列数据的交互式可视化。 Zbl 1255.68272号Michel A.Westenberg。;van Hijum,Sacha A.F.T。;安德烈·卢尔科(Andrzej T.Lulko)。;奥斯卡·P·柯伊伯。;Jos B.T.M.罗尔丁克。 2008 全部的 前5名8位作者引用 1 郭晓阳 1 奥斯卡·P·柯伊伯。 1 安德烈·卢尔科(Andrzej T.Lulko)。 1 Jos B.T.M.罗尔丁克。 1 萨卡·苏迪普 1 阿努伊·斯利瓦斯塔瓦 1 van Hijum,Sacha A.F.T。 1 米歇尔·阿尔扬·韦斯坦伯格 连载1篇 1 数学成像与视觉杂志 在3个字段中引用 2 统计学(62-XX) 1 计算机科学(68至XX) 1 生物学和其他自然科学(92-XX) 按年份列出的引文