宇宙

DNA序列中保守基序的监督检测。cosmo搜索一组未对齐的DNA序列,寻找一个共享的基序,例如,可能代表一个共同的转录因子结合位点。该算法类似于模因,但也允许用户指定一组约束条件,该约束条件是未知模体的位置权重矩阵必须满足的。例如,这种约束可以包括对未知基序的某些区域的信息内容的限制,并且通常可以基于有关所述转录因子的结构的先验知识来制定。未知的模体宽度、模体出现的分布(OOPS、ZOOPS或TCM)以及适当的约束集可以自适应地选择。

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